单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
TCR库是体内TCR集合,也被认为是对于抗原特异性评价T细胞反应的新指标。新一代测序(NGS)技术TCR测序使个体TCR序列可以被检测出来。目前,TCR全库分析已被广泛应用于感染性疾病(6)、移植免疫(7)、肿瘤免疫(8)等多个医学领域。在本文中,作者对TCRseq方法进行...
TCR测序主要用于分析T细胞受体的多样性和克隆组成,揭示T细胞的免疫应答特征。这项技术可以帮助研究免疫系统对不同抗原的反应,广泛应用于癌症免疫治疗、感染性疾病研究和自身免疫疾病的机制探索。通过测序,可以获取TCR的CDR3区域序列,评估克隆扩增和免疫组库的多样性,为疾病诊断和治疗提供关键信息。
对于TCR而言,具有成对的α和β信息,对于BCR,具有重和轻的信息对于表征治疗性分子至关重要。 传统bulk高通量测序方法还不能获得双链准确的配对信息,因为生成准确配对信息需要获取单个细胞水平的数据。 单细胞测序能帮助您: •免疫细胞图谱•B细胞和T细胞受体分析•抗体发现•组织浸润淋巴细胞表征•TCR-T细胞免疫...
TCR测序相关结果 图1 注:a. 高和低TCR克隆性亚组的总生存率;b. 高和低TCR克隆性亚组的无进展生存率。 图2 注:a总的生存率;b无进展生存率。 仅凭TCR克隆性并不能有效地预测临床结果(图1)。然而,当TCR克隆性与分子肿瘤负荷指数(mTBI)结合时,对OS获益的预测能力可以增强。TCR克隆性高、mTBI低的患者中位...
这个问题,目前也是不清楚的。来自斯坦福大学医学院的研究团队,从接受 PD- 1 抗体治疗前后的基底细胞癌(BCC)或鳞状细胞癌(SCC)患者身上采集了 79046 个细胞(包括癌细胞和各种免疫细胞),进行了单细胞 RNA 测序和 TCR 测序。基于单细胞 RNA 测序结果,细胞分成 19 个亚群。
测序方法：TCR测序方法包括多重PCR、目标区域捕获和5’ RACE扩增。多重PCR适用于DNA和RNA样本，可同时扩增α链和β链；目标区域捕获方法处理α和β链，减少PCR偏好性影响；5’ RACE法合成完整cDNA，覆盖完整V基因，保留TCR和VDJ区域。TCR分析方法： 技术限制解决：TCR分析需解决测序仪读取错误...
TCR/BCR 测序简介 TCR(T 细胞受体)和 BCR(B 细胞受体)测序主要用于研究 适应性免疫系统,分析 T 细胞和 B 细胞的克隆多样性、抗原识别能力和免疫应答。与传统的 scRNA-seq 只检测 基因表达 不同,TCR/BCR 测序专注于 免疫受体的重排序列。 1. 什么是 TCR 和 BCR? TCR(T 细胞受体) 由α链(TRA)和β链...
基于多重PCR(Multiple PCR)的方法可以同时扩增α链和β链,但是这种方法通常在文库制备和测序这两个环节会造成一定的误差。无论如何,PCR扩增法已被证实能够提高结果的准确性和特异性。 CDR3是许多TCR测序优先选择的研究目标区域,因为CDR3的TCR能够与多肽以及抗原直接项目作用。
免疫组库指机体内TCR和BCR多样性的集合,可以全面地反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力,可以用于表征机体免疫系统的健康状况。表观生物正式上线免疫组库测序技术服务(TCR/BCR-seq),以T/B淋巴细胞为研究目标,以富集扩增决定BCR或TCR多样性的CDR区,再结合高通量测序技术,全面评估免疫系统的多样性,深...