为了验证CD20+B细胞在结直肠癌中的预测预后作用,对另外209例患者进行了免疫组化染色,与上述TCGA结果一致。 IHC染色结果一致显示CD20+B细胞与CRC患者,特别是RCC患者的生存率提高呈正相关,这种关联可能归因于三级淋巴结构的存在。 细胞-细胞相互作用分析预测CD20+B细胞通过募集和粘附其他免疫淋巴细胞来调节TME。 CD20+B...
建立一个多基因信号,以帮助更好地III期肾细胞癌(RCC)患者的预后进行预测。方法 ★从GEO数据库中下载GSE53757数据集,包括14对癌症和正常组织的表达数据,从TCGA数据库中下载16对mRNA,表达谱数据(下载的是RNA-seq测序数据,需要提取mRNA数据)。★差异表达分析,对共同差异表达基因进行进一步分析。★对TCGA中选择肾癌Ⅲ期...
从TCGA数据库中发现了另外3例最初诊断为ChRCC或PRCC的病例,测序后重新分类为混合RCC与MTOR激酶结构域突变,并且如预期的那样缺乏fox1和LINC01 187基因表达。 四、小结 本文中作者结合了TCGA、内部RCC分析和正常人肾组织scRNA-seq研究,并对来自1049个RCC标本的RNA测序数据进行综合分析,在ChRCC中鉴定出了ChRCC中FOXI1...
肾细胞癌(RCC)是全球泌尿系统肿瘤中的第三大常见恶性肿瘤,也是36种癌症中的第十六大常见癌症。乳头状肾细胞癌(pRCC)是仅次于肾透明细胞癌(ccRCC)的RCC第二常见组织学亚型,占RCC的15%-20%。据报道,pRCC与世界上广泛存在的ccRCC在临床病理特征和预后上存在较大差异。然而,相对更多的研究集中于ccRCC而不是pRCC, pRC...
Radiogenomics of clear cell renal cell carcinoma: preliminary findings of The Cancer Genome Atlas-Renal Cell Carcinoma (TCGA-RCC) Imaging Research Group. Abdom Imaging 2015;40:1684-92.Shinagare, A.B., Vikram, R., Jaffe, C., Akin, O., Kirby, J., et al.: Radiogenomics of clear cell ...
肾细胞癌(RCC)是最致命的泌尿生殖系统肿瘤。最新的癌症统计报告表明每年在美国有超过65,000例新病例,造成近15,000人死亡,这使它成为男性中第六最常见的肿瘤。透明细胞癌(ccRCC)是细胞癌最常见的类型(80%)。临床上,高达16%的ccRCC患者诊断时已发生转移,并且5年存活率仅为12%。目前肿瘤学和外科学的发展只是略有...
在2021年10月发表的一篇7分+的纯生信文章中,作者分析左半结肠癌(LCC)和右半结肠癌(RCC)具有独特的分子特征和临床异质性,旨在确定LCC和RCC的免疫细胞浸润(ICI)亚型以评估其预后和治疗效果。 研究过程中,作者便从TCIA数据库下载了结肠癌患者的免疫表型评分(IPS) ...
肾细胞癌（renal cell carcinoma，RCC）是最常见的泌尿系肿瘤，肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）约其占70-80%[1]。ccRCC发病机制目前尚不清楚，可能与吸烟、遗传等因素相关。其对放、化疗不敏感，局部手术治疗是早期肾癌的主要治疗方法。晚期肾癌的靶向药物选择因为缺乏明确的靶点而非常局限。[...
Radiogenomics of clear cell renal cell carcinoma: preliminary findings of The Cancer Genome Atlas–Renal Cell Carcinoma (TCGA–RCC) Imaging Research Groupdoi:10.1007/s00261-015-0386-zClear cell renal cell carcinomaCTMRIMutational statusRadiogenomics...
inChRCC Blue,lowuponoxidative inChRCCphosphorylation Yellow,mt mutation WholeGenomeysis KataegisobservedinChRCC DavisC,WheelerD mRNAn=50ChRCC correlates ofkataegis CreightonC, DavisC IncludesTERT CaseswithmRNAexpression kataegis(n=3)lowhigh TERTPMStructural ...