TCGA的LUAD数据对于深入研究肺腺癌的发病机制和潜在治疗靶点起到了关键作用。 3. LUSC(Lung Squamous Cell Carcinoma):肺鳞癌。 肺鳞癌是肺癌的另一主要亚型,它起源于肺部表皮细胞中的鳞状细胞。TCGA的LUSC数据有助于揭示肺鳞癌的分子机制和个体化治疗策略。 4. PRAD(Prostate Adenocarcinoma):前列腺腺癌。 前列腺癌...
当然,也可以根据情况,对其中的癌症类型进行合并,比如自己定义 LUNG,LUNG 里面包含了LUAD(Lung adenocarcinoma)和 LUSC(Lung squamous cell carcinoma),比如第一幅图中的最左边的一组数据,里面就是 LUNG Normal 和 LUNG Cancer,如果你只有一个 Normal,而有两个 Cancer 类型,这个数据呈现的格式跟其他组的放在一起就...
6.2.4 TCGA-LUAD 6.2.5 TCGA-LUSC 6.2.6 分析 代码gitee地址 参考资料 1.目的 通过实际数据集上的编程实践,掌握高维数据常用的数据探索与可视化技术,观察和理解“维数灾难”问题的涵义、以及相似性度量和维归约的重要性。 2.数据 癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas Program, TCGA)数据库 (https://portal...
LUAD 肺腺癌 LUSC 肺鳞状细胞癌 MESO 胸膜癌 OV 卵巢癌 PAAD 胰腺癌 PCPG 肾上腺癌 PRAD 前列腺癌 READ 直肠癌 SARC 软组织癌 SKCM 皮肤癌 STAD 胃癌 TGCT 睾丸癌 THCA 甲状腺癌 THYM 胸腺癌 UCEC 子宫内膜癌 UCS 子宫癌 UVM 眼癌 这样展示给大家,会不会很唐突,大家保存就是了,整理是需要时间和经理的...
KIRC Kidney renal clear cell carcinoma 肾透明细胞癌 KIRP Kidney renal papillary cell carcinoma 肾乳头状细胞癌 LAML Acute Myeloid Leukemia 急性髓细胞样白血病 LGG Brain Lower Grade Glioma 脑低级别胶质瘤 LIHC Liver hepatocellular carcinoma 肝细胞肝癌 LUAD Lung adenocarcinoma 肺腺癌 LUSC Lung squamous ce...
LUAD Lung adenocarcinoma 肺腺癌 LUSC Lung squamous cell carcinoma 肺鳞癌 MESO Mesothelioma 间皮瘤 OV Ovarian serous cystadenocarcinoma 卵巢浆液性囊腺癌 PAAD Pancreatic adenocarcinoma 胰腺癌 PCPG Pheochromocytoma and Paraganglioma 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤 PRAD Prostate adenocarcinoma 前列腺癌 READ Rectum adenoc...
1.TCGA简介 TCGA(The Cancer Genome Atlas)收集了大量癌症样本的数据,涉及33种不同癌症、超过 20000个样本,包括外显子组测序、RNA 测序、microRNA 测序、拷贝数变异、蛋白质组和甲基化组,临床信息等数据,研…
KIRP kidney papillary cell carcinoma 肾乳头状细胞癌 LAML acute myeloid leukemia 急性髓细胞样白血病 LGG brain lower grade glioma 脑低级别胶质瘤 LIHC liver hepatocellular carcinoma 肝细胞肝癌 LUAD lung adenocarcinoma 肺腺癌 LUSC lung squamous cell carcinoma 肺鳞癌 ...
KIRP Kidney renal papillary cell carcinoma 肾乳头状细胞癌 LAML Acute Myeloid Leukemia 急性髓细胞样白血病 LGG Brain Lower Grade Glioma 脑低级别胶质瘤 LIHC Liver hepatocellular carcinoma 肝细胞肝癌 LUAD Lung adenocarcinoma 肺腺癌 LUSC Lung squamous cell carcinoma 肺鳞癌 ...
LUAD 肺腺癌 LUSC 肺鳞状细胞癌 MESO 胸膜癌 OV 卵巢癌 PAAD 胰腺癌 PCPG 肾上腺癌 PRAD 前列腺癌 READ 直肠癌 SARC 软组织癌 SKCM 皮肤癌 STAD 胃癌 TGCT 睾丸癌 THCA 甲状腺癌 THYM 胸腺癌 UCEC 子宫内膜癌 UCS 子宫癌 UVM 眼癌 这样展示给大家,会不会很唐突,大家保存就是了,整理是需要时间和经理的...