6.2.1 TCGA-BLCA 6.2.1 TCGA-BRCA 6.2.3 TCGA-LGG 6.2.4 TCGA-LUAD 6.2.5 TCGA-LUSC 6.2.6 分析 代码gitee地址 参考资料 1.目的 通过实际数据集上的编程实践,掌握高维数据常用的数据探索与可视化技术,观察和理解“维数灾难”问题的涵义、以及相似性度量和维归约的重要性。 2.数据 癌症基因图谱(The Cancer...
以下是下载TCGA-BLCA膀胱癌count/TPM数据的演示。 步骤1:进入网站 首先,我们用谷歌浏览器点开新版网站的首页。 https://portal.gdc.cancer.gov/portal.gdc.cancer.gov/ 步骤2:检查购物车 点开首页右上角的Cart按钮 点击网站logo下方蓝条中的红色按钮,对购物车中已有的数据进行清空 3 选定并保存自己所需的项...
在执行重复交叉验证过程中,JADBio 采用了多种技术以加速计算,同时保持结果的质量;例如,如果性能改进被认为不太可能,系统可以自动决定跳过进一步的交叉验证重复操作。 对于所有分析,调整工作强度均设置为"广泛",但以下情况除外:BLCA、COADREAD、LGGGBM、LUSC 设置为"初步",而 GEA、HNSC、LUAD、OV、SKCM、THCA 和 UC...
BLCA bladder urothelial carcinoma 膀胱尿路上皮癌 BRCA breast invasive carcinoma 乳腺浸润癌 CESC cervical & endocervical cancer 宫颈鳞癌和腺癌 CHOL cholangiocarcinoma 胆管癌 COAD colon adenocarcinoma 结肠癌 DLBC diffuse large B-cell lymphoma 弥漫性大B细胞淋巴瘤 ESCA esophageal carcinoma 食管癌 GBM glioblas...
Cohort英文名称中文名称 ACC Adrenocortical carcinoma 肾上腺皮质癌 BLCA Bladder Urothelial Carcinoma 膀胱尿路上皮癌 BRCA Breast invasive carcinoma 乳腺浸润癌 CESC Cervical squamo
Cohort英文名称中文名称 ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌 BLCABladder Urothelial Carcinoma膀胱尿路上皮癌 BRCABreast invasive carcinoma乳腺浸润癌 CESCCervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma宫颈鳞癌和腺癌 CHOLCholangiocarcinoma胆管癌 ...
BLCA 膀胱癌 BRCA 乳腺癌 CESC 宫颈鳞状细胞癌 CHOL 胆癌 COAD 结肠癌 DLBC 淋巴癌 ESCA 食管癌 GBMLGG 脑癌 HNSC 头颈部鳞癌 KICH 嫌色细胞癌 KIRC 肾透明细胞癌 KIRP 乳头状肾细胞癌 LAML 骨髓癌 LIHC 肝癌 LUAD 肺腺癌 LUSC 肺鳞状细胞癌 MESO 胸膜癌 ...
步骤1：进入网站 使用谷歌浏览器打开新版TCGA网站，进入首页。步骤2：清空购物车 点击右上角的Cart按钮，进入购物车页面，点击网站logo下方蓝条中的红色按钮清空购物车。步骤3：选定并保存项目 点击logo下方的Projects，从左侧勾选框中找到Program，勾选TCGA，右侧找到需要的癌种BLCA，点击TCGA-BLCA超链接。...
BLCA 膀胱尿路上皮癌 BRCA 乳腺癌浸润癌 CESC 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内腺癌 CHOL 胆管癌 COAD 结肠腺癌 DLBC 淋巴肿瘤弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 ESCA食管癌 GBM 多形性胶质母细胞瘤 HNSC 头颈部鳞状细胞癌 KICH肾嫌色剂 KIRC 肾肾透明细胞癌 KIRP 肾肾乳头状细胞癌 LAML 急性髓系白血病 LGG 脑低级...
摘要:目的 探讨基于癌症基因组图谱(TCGA)/癌症成像档案馆(TCIA)的CT放射组学对膀胱癌(BLCA)经典致癌信号通路状态无创预测的价值。方法 从TCGA/TCIA公共数据库筛选的69例BLCA患者(训练队列55例,验证队列14例)回顾性地纳入本研究,并用于分析放射组学与P13K、RTK RAS、NOTCH以及TP53经典致癌信号通路状态的关系。基于增强...