再次体验一下TBtools的强大。使用TBtools对基因家族进行分析,进化树、Motifs 、结构域和基因结构多图合一。 欢迎关注公众号:生信艺术家 干货全拿走! 一、数据准备 1.基因组组装结果fasta格式 2.基因组注释结果gff3格式 3.模式物种或近缘物种的基因家族的蛋白序列fasta格式 ...
最后，基因家族的进化分析通过MEGA构建进化树，输入目标物种P450基因家族的蛋白质序列，进行多序列比对，然后使用最大似然法构建进化树。所有结果在TBtools中展示，包括进化树、Motifs、结构域和基因结构的综合视图。总之，TBtools提供了一个全面的基因家族分析平台，从数据准备到结果展示，简化了复杂分析流程，提...
gff格式,第四个Batch-CDD结果文件(这个需要手动修改,第一列基因名,第二列,起始位置,第三列终止位置,第四列蛋白质结构域)。 640.png 640.png 这样基因家族进行分析,进化树、Motifs 、结构域和基因结构的一张图就画好了。 总的来说TBtools进行基因家族分析还是非常方便的,图形界面的操作用文字描述有些不便学习操...