r语言tbl_df 含有列表 r语言dgelist函数 ***注:本文为作者个人理解,如有不同见解欢迎指正o(^∀^)o *** edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据,每行对应一个基因,每一列对应一个样本。建议使用htseq-count进行统计,输出文件即可直接使用。如果需要...
可能是由于以下原因之一: 数据类型不匹配:tbl_df是dplyr包中的一种数据类型,而xlsx包通常处理的是data.frame类型的数据。因此,在导出之前,需要将tbl_df转换为data.frame类型。可以使用as.data.frame()函数将tbl_df转换为data.frame。 缺少xlsx包:xlsx包是R中用于处理Excel文件的包。如果没有安装该包,可以使...
R语言bedtools实现 r语言tbl_df R包dplyr可用于处理R内部或者外部的结构化数据,相较于plyr包,dplyr专注接受dataframe对象, 大幅提高了速度,并且提供了更稳健的数据库接口。同时,dplyr包可用于操作Spark的dataframe。本文只是基础的dplyr包学习笔记,所以并不会讨论一些高级应用,或者与data.table包的性能比较。 1. 数据...
然后,创建了一个示例的tbl_df数据框对象,包含了日期和对应的数值。 接下来,通过使用dplyr包中的mutate函数将日期列转换为日期格式,确保数据的正确性。 然后,使用dplyr包中的select函数选择日期和数值两列,再使用tidyr包中的pivot_wider函数将数据重新排列成宽格式,其中日期作为列名,数值作为对应的值。 之后,使用as....
Jupyter中R包中的tbl_df（）表示什么？Jupyter中R包中的tbl_df（）表示什么？将数据转换为一种特殊的...
(b, s = 1)) #> # A tibble: 4 x 2 #> a b #> <fct> <dbl> #> 1 Mango 1 #> 2 Metro NA #> 3 Rain NA #> 4 M NA # using base R t$b <- recode(t$b, s = 1) # or # t[, 2][] <- recode(t[, 2, drop = TRUE], s = 1) t #> # A tibble: 4 x 2 ...
load("results/TCGA_RNASeq_PanCancer.RData") gsva(ExprMatList = list(TCGA_RNASeq_PanCancer), merged_geneList, group_col = "Cell_type", gene_col = "Symbol", method = "gsva")-> res_pancan.GSVA then I saw this error: Error in (function (classes, fdef, mtable) : ...
desc masks IRanges::desc## x tidyr::expand masks S4Vectors::expand## x dplyr::filter masks stats::filter## x dplyr::first masks S4Vectors::first## x dplyr::lag masks stats::lag## x purrr::none masks locfit::none## x ggplot2::Position masks BiocGenerics::Position, base::Position#...
display tm slot probe qmc-tbl-depth命令行用于查询QMC打印表容量。 命令格式 display tm slotslot-idchip-idchip-idprobeqmc-tbl-depth 参数说明 参数参数说明取值 chip-idchip-id 芯片号。 整数形式,取值范围是0～7 slotslot-id 槽位号。 整数形式,取值范围是1～15 ...
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