SWISS-MODEL是一款基于同源建模法的全自动在线工具,用于预测未知蛋白质的三维结构。它通过比对目标序列与已知结构的蛋白质序列,快速生成结构模型,服务于蛋白质功能研究、药物开发及疾病机制探索等领域。以下从核心原理、主要功能、应用场景和优势特点四方面展开说明。 一、核心原理:同源建模...
SWISS-MODEL是一款用同源建模法预测蛋白质三级结构的全自动在线软件。SWISS-MODEL中一共有三个工作方式:First Approach mode:Alignment Interface mode:Project(Optimise)mode: 预测效果(使用范围) 如果目标序列与模板序列一致度极高,那么同源建模法是最准确的方法。 如果一致度能达到30%,那么模型的准确度就可以达到80%...
1)打开SWISS-MODEL官网,点击Start Modelling; 2)将我们准备好的氨基酸序列粘贴进指定窗口,序列自动识别如果没有问题的情况下氨基酸序列会变成有颜色背景的格式: 3)填写好自己的Project Title及Email(选填);4)点击Build Model开始运行; 5)根据氨基酸序列长短会运行几分钟到几小时不等(运行结束时所填写邮箱会收到通知)...
3D Structure model 1.利用Phyre网站(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre2/html/page.cgi?id=index)在线对目的序列三级结构进行预测,提交后,下载生成的pdb文件。利用PDB数据库(http://www.rcsb.org/)下载同源序列的pdb文件(有的序列PDB数据库找不到也可在Phyre进行预测)。 PDB数据库:点击Sequences,在新页...
SWISS-MODEL的官网地址:https://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html。蛋白质组学分析,包括蛋白质一级结构,二级结构,三级结构,亲疏水性,磷酸化位点,理化性质以及蛋白互作分析等。如果需要基因家族分析,转录组学分析,蛋白质组学分析,可将需求及分析对象发送至
1、SWISS-MODEL日质结构预测SWISS-MODE是一项预测蛋白质三级结构的服务,它利用同源建模的方法实现对一段未知序列的三级结构的预测。该服务创建于1993年,开创了自动建模的先河,并且它是讫今为止应用最广泛的免费服务之一。同源建模法预测蛋白质三级结构一般由四步完成:1. 从待测蛋白质序列 出发,搜索蛋白质结构数据库(...
SWISS-MODEL是一款用同源建模法预测蛋白质三级结构的全自动在线软件。SWISS-MODEL中一共有三个工作方式:First Approach mode:Alignment Interface mode:Project(Optimise)mode: 预测效果(使用范围) 如果目标序列与模板序列一致度极高,那么同源建模法是最准确的方法。
SWISS-MODEL 蛋白质结构预测 SWISS-MODEL是一项预测蛋白质三级结构的服务,它利用同源建模的方法实现对一段未知序列的三级结构的预测。该服务创建于1993年,开创了自动建模的先河,并且它是讫今为止应用最广泛的免费服务之一。同源建模法预测蛋白质三级结构一般由四步完成:从待测蛋白质序列出发,搜索蛋白质结构数据库(如PDB...
swiss-model蛋白三维结构预测蛋白三维结构模型预测LHCGR基因NM_000233,c.547G>A,p.G183R蛋白质三维结构预 测方法概览比较建模法 比较建模又称同源建模,原理简单,是基于计划相关的序列具有相似的三维结构且进化过程中三维结构比序列保守的原理, 利用计划相关模板结构信息建模。 基本步骤:1)将目标序列作为查询序列,在已...