STRING数据库是一个基于公共数据库和文献信息的蛋白质相互作用网络数据库。它收集了多个公共数据库,包括UniProt、KEGG、NCBI和Gene Ontology等,整合了这些数据并生成一个全面的蛋白质相互作用网络数据库。 STRING数据库不仅提供了蛋白质相互作用网络的可视化,还能够提供蛋白质家族、途径和亚细胞定位等信息。 除此之外,STRIN...
缓存:使用 String 数据结构可以方便地实现缓存功能,将需要频繁读取的数据存储在缓存中,提高程序性能。 计数器:使用 String 数据结构的自增操作,可以快速实现计数器功能。 分布式锁:使用 String 数据结构的 setnx(set if not exists) 操作可以实现分布式锁,保证对某个资源的互斥访问。 数据库连接池:使用 String 数据...
用户可以通过STRING数据库官方网站进行访问，输入蛋白质或基因名称以检索与之相关的蛋白质相互作用网络。对于单个蛋白质，数据库生成包含所有相互作用蛋白质的网络图；而输入多个蛋白质时，仅显示这些蛋白质之间的相互作用，适用于差异基因分析。搜索完成，用户获得蛋白质相互作用网络图，其中节点代表蛋白质，连线...
研究蛋白之间的相互作用网络,有助于挖掘核心的调控基因,目前已经有很多的蛋白质相互作用的数据库,而string绝对是其中覆盖的物种最多,相互作用信息做大的一个,网址如下 https://string-db.org/ 该数据库的最新版本为version 10.5, 更新于2017年5月14号,存储了2031个物种,9643763种蛋白,共1380838440个相互作用的信息。
STRING:蛋白相互作用数据库的使用 点击蓝字 关注我们 昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础)。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其...
String数据库(https://string-db.org/)是目前数据量最丰富、应用最广泛的研究蛋白质相互作用的数据库之一。目前,String数据库已更新到Version 11.5版本。收录了超过14000个物种、6千多万种蛋白、200多亿个相互作用的信息。这些蛋白质相互作用既包括直接的物理作用,也包括间接的功能相关性。通过STRING数据库,我们可以很...
STRING数据库简介STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）是一个在线的生物信息学数据库，旨在提供基因和蛋白质相互作用的信息。该数据库整合了多种数据来源，包括实验室实验、文献报道和计算预测，以提供全面的相互作用网络。STRING数据库还提供了许多工具和功能，例如基因和蛋白质注释、...
string::iterator与string::const_iterator是string定义的迭代器类型,分别为非常量迭代器和常量迭代器,其作用与指针有相似之处,都可以进行递增、递减操作,都可以通过解引用获得string中的元素。非常量迭代器允许改变其所指向的元素,常量迭代器不允许。 string成员函数begin、end与size的用途和原理,与实验一中vector的同名...
STRING数据库是蛋白质相互作用分析的强大工具，网址为string-db.org。打开数据库主页，左侧提供输入选项，能根据您感兴趣的目标蛋白名称或序列进行搜索。以EGFR蛋白为例，输入后选择数据来源为人，点击搜索。搜索后，将进入结果界面。点击继续，显示与EGFR存在相互作用的蛋白网络。网络下方有多种选项，包括查看...