我们在打开数据库之后,在菜单栏可以看到很多种来进行相互作用关系预测的选项。如果我们有一个目标蛋白,想要查看这个蛋白的可能的相互作用蛋白可以选择Protein by name;如果我们有很多蛋白,想要查看这些蛋白之间的相互作用关系,那就可以选择Multiple proteins。 由于我们在之前的差异表达分析的时候,可以得到很多基因,所以我们...
常见的使用方法有两种:检索和分析。检索功能允许用户根据特定的蛋白质或分子的名称或标识符数据库中的相互作用信息。分析功能则利用算法和网络分析工具对相互作用数据进行进一步的研究。此外,一些数据库还提供交互式网络图可视化功能,帮助用户更好地理解蛋白质相互作用网络的结构和功能。 最后,蛋白质相互作用数据库在生命...
Domain是蛋白质最小的功能单元，它们之间的相互作用一定程度上就决定了蛋白质之间的相互作用。按照这个方法将所有的氨基酸序列进行聚类，如果类与类之间的相互作用的序列对的个数超过了一定阈值，则表示与两个类的代表序列同源的蛋白质之间都可能会发生相互作用。12) 根据蛋白结构来预测蛋白相互作用 Lappe等人...
Domain是蛋白质最小的功能单元，它们之间的相互作用一定程度上就决定了蛋白质之间的相互作用。按照这个方法将所有的氨基酸序列进行聚类，如果类与类之间的相互作用的序列对的个数超过了一定阈值，则表示与两个类的代表序列同源的蛋白质之间都可能会发生相互作用。12) 根据蛋白结构来预测蛋白相互作用 Lappe等人...
STRING:蛋白相互作用数据库的使用 昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础)。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其强大的可视化,以及自...
蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其强大的可视化,以及自定义功能。这样我们可以得到数据结果的同时,还可以得到相对好看的图。下面我们就来介绍一下STRING 数据库如何使用吧~ 基本检索 我们在打开数据库之后,在菜单栏可以看到很多种来进行相互作用关系预测的选项。如果我们有一个目标蛋白,想要...
STRING:蛋白相互作用数据库的使用 昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识( )。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其强大的可视化,以及自定义功能。这样我们...
对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其强大的可视化,以及自定义功能。这样我们可以得到数据结果的同时,还可以得到相对好看的图。...
昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础)。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用分析的数据库有很多,至于为什么选择STRING,还是在于其强大的可视化,以及自定义功能。这样我们可以得到数据结果的...
STRING:蛋白相互作用数据库的使用2021 01/12 医学数据库百科 个人 + 分享 医学数据库百科 A- A+ 昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识( 相互作用网络分析基础 )。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein-protein ineraction, PPI)分析了。 蛋白相互作用...