winsteny创建的收藏夹实验内容:通俗易懂一步步教你做PPI(蛋白质-蛋白质互作)网络图!String+Cytoscape基本操作演示,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(proteinprotein interaction network,PPInetwork)。具体而言,这些相关的文献中首先通过RNA-seq、表达谱芯片或者蛋白质组分析等,找到了在不同分组样本间一系列的差异表达基因或蛋白。随后,通过STRING数据库(https://string-db.org/)检索了编码蛋白间可能...
板鸭Mei酱创建的收藏夹基因网络论文内容:通俗易懂一步步教你做PPI(蛋白质-蛋白质互作)网络图!String+Cytoscape基本操作演示,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
PPI数据直接用于识别蛋白多聚复合体和预测蛋白功能,也可用于药物设计。 到底是什么工具可以帮我们做PPI分析? https://string-db.org/ String数据库是一个在线搜索已知蛋白之间和预测蛋白质之间互作关系的数据库。它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还利用了生物信息学方法预测的结...
也可以直接用get_interactions函数得到所有的PPI数据,然后写入到本地,再导入到cytoscape进行画图 还以几个小功能,对我可能没什么用,但是比较适合初学者,仅仅根据string 数据库的蛋白ID就可以做GO/KEGG的enrichment分析啦,还可以查找两个蛋白的interaction呀,还有两个蛋白直接相互作用的paper呀,还有找某个蛋白在其它物种的...
解螺旋送课活动来了,免费送课啦 新人完成认证即可免费领一门解螺旋科研课,图中的课程任意挑。之前扫过码领过书的,需要邀请1个新人,然后自己也可以免费领课,新人也领一门课。 解螺旋的课程值得推荐给读研的新朋友和老朋友,不是自己确认过的好课,我从来不推荐。我当初就是因为接触解螺旋比较晚,吃了蛮多亏,科研技...
用倒数第二个文件即可：
中药复方网络药理学:12.1 基于Bisogenet的PPI网络构建和筛选(一) 誉川中医药 45:19 野菜茎小甜饼 05:04 cytoscape 做成分-靶点-通路-疾病-图 烟花步冷 【AlphaFold 3】预测蛋白质、DNA、RNA、配体的结构和相互作用 手机用户8188 09:32 用STRING网站预测蛋白之间互作关系 ...
PPI网络:蛋白互作网络的构建与核心基因的筛选(string数据库,cytoscape软件与cytoNCA插件) 春秋至-生信碱移 19.4万344 05:58 成分—通路—基因靶点网络的构建 黑眉锦蛇呀 15:17 STRING和PPI_Cytoscape个性化绘图 人工智能学术前沿 15:07 python批量获取PPI互作数据+Cytoscape作图教程 ...
7. PPI蛋白网络相互作用构建(STRING) 药学生阿程 2.8万9 以一个实际的网络图可视化过程,简介Gephi基本操作 大病烧滑稽 7.9万45 43:26 cytoscape网络图优化 葳蕤闪_闪_ 4.7万111 11:04 Cytoscape 绘图,相互作用网络显示了药物的核心生物靶点、药理功能和信号通路 ...