-, 视频播放量 42841、弹幕量 23、点赞数 1032、投硬币枚数 591、收藏人数 3115、转发人数 381, 视频作者 飞猪Doctor, 作者简介 我是飞猪,暨大临床在读博士,乐于分享科研相关的基本知识和小技巧,偶尔也分享些好歌,希望能对你有所帮助!,相关视频:PPI网络:蛋白互作网
在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(proteinprotein interaction network,PPInetwork)。具体而言,这些相关的文献中首先通过RNA-seq、表达谱芯片或者蛋白质组分析等,找到了在不同分组样本间一系列的差异表达基因或蛋白。随后,通过STRING数据库(https://string-db.org/)检索了编码蛋白间可能...
PPI数据直接用于识别蛋白多聚复合体和预测蛋白功能,也可用于药物设计。 到底是什么工具可以帮我们做PPI分析? https://string-db.org/ String数据库是一个在线搜索已知蛋白之间和预测蛋白质之间互作关系的数据库。它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还利用了生物信息学方法预测的结...
然后用string_db$map函数给它加上一列是 string 数据库的蛋白ID,然后用string_db$add_diff_exp_color函数给它加上一列是color。 用string_db$plot_network函数画网络图,只需要 string 数据库的蛋白ID,如果需要给蛋白标记不同的颜色,需要用string_db$post_payload来把color对应到每个蛋白,然后再画网络图。 也可...
中药复方网络药理学:12.1 基于Bisogenet的PPI网络构建和筛选(一) 誉川中医药 45:19 野菜茎小甜饼 05:04 cytoscape 做成分-靶点-通路-疾病-图 烟花步冷 【AlphaFold 3】预测蛋白质、DNA、RNA、配体的结构和相互作用 手机用户8188 09:32 用STRING网站预测蛋白之间互作关系 ...
PPI网络:蛋白互作网络的构建与核心基因的筛选(string数据库,cytoscape软件与cytoNCA插件) 春秋至-生信碱移 19.4万344 05:58 成分—通路—基因靶点网络的构建 黑眉锦蛇呀 15:17 STRING和PPI_Cytoscape个性化绘图 人工智能学术前沿 15:07 python批量获取PPI互作数据+Cytoscape作图教程 ...
解螺旋送课活动来了,免费送课啦 新人完成认证即可免费领一门解螺旋科研课,图中的课程任意挑。之前扫过码领过书的,需要邀请1个新人,然后自己也可以免费领课,新人也领一门课。 解螺旋的课程值得推荐给读研的新朋友和老朋友,不是自己确认过的好课,我从来不推荐。我当初就是因为接触解螺旋比较晚,吃了蛮多亏,科研技...
桓望丶创建的收藏夹默认收藏夹内容:如何用cytoscape做一个美观精致的PPI网络图?下期出string网站的教程,点个关注持续关注吧~,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
如何用cytoscape做一个美观精致的PPI网络图?下期出string网站的教程,点个关注持续关注吧~ 16.7万播放 网络药理学-Part 3-GO与KEGG 富集分析(Metascape与DAVID数据使用收集数据) 2.2万播放 【string数据库】【生物信息学】STRING数据库的介绍和使用,希望对有需要的人有所帮助 ️ 2.9万播放 自学网络药理学用 请勿...
药物疾病网络:网络药理学寻找药物间接靶点,使用cytoscape软件中的mcode插件通过ppi蛋白互作网络寻找药物疾病间接靶点,构建药物疾病调控网络 1.2万播放 【生信分析-25】Cytoscape插件:MCODE使用 2.8万播放 【gene ID】gene ID转换的在线工具 1.6万播放 GEO数据下载及处理,史上最简单的方法,无代码,含gene symbol类型GPL570...