简单重复序列（Simple Sequence Repeat，简称SSR），是指重复单位长度和碱基组成基本一致，只有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术。术语简介 1982年，Hamade等人发现了简单重复序列标记(SSR)技术，或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence，MS)，或短串联重复标记( ...
SSR标记是最常见的共显性标记,这种标记的读带方式主要有以下几种: 1.0/1数值型标记:与显性标记一样,可以转化为: 2.字母型标记:参照显性标记条带数据的记录步骤,从下往上根据确定的位点,以A、B、C……进行标记,由于二倍体的共显性标记是一对等位基因,因此从上图可知,样本1~4的条带可以转化为以下字母型的数...
SSR标记的基本原理是，根据微卫星序列两端互补序列设计引物，通过PCR反应扩增微卫星片段。由于核心序列串联重复数目不同，能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物。将这些产物进行凝胶电泳，根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。SSR标记具有一些优点，如一般检测到的是一个单一的多等位基因位点、微卫星呈共...
尽管微卫星 DNA分布于整个基因组的不同位置,但其两端序列多是保守的单拷贝序列,根据这两端的序列设计一对特异引物,通过PCR技术将期间的核心微卫星DNA序列扩增出来,利用电泳分析技术就可以得到其长度的多态性,此即 SSR标记的原理。 不同的基...
SSR 标记数量丰富，覆盖整个基因组，而且分布均匀，多态性高，呈共显性遗传，重复性好，操作简便，是一种理想的分子标记技术，被广泛应用于构建基因连锁图分子辅助育种品种鉴定遗传资源的保存等方面。试剂配制 1. 0.2%亲水 binding silence（现配现用）：1500μL95%乙醇，7.5μL 冰醋酸，再加入 3μLbinding ...
ISSR标记是另一种包含显性DNA序列的DNA标记。重复序列长约100-300个核苷酸。ISSR标记通过使用引物扩增，引物退火到基因组中两个相邻微卫星区域的互补序列。因此，它允许在单个实验中分析多个位点。然而，ISSR标记出现在两个微卫星重复序列之间。因此，ISSR标记允许扩增基因组中的随机DNA序列。图 2：SSR 标记 由于ISSR...
SSR简单序列重复标记(Simple sequence repeat,简称SSR标记),也叫微卫星序列重复,是由一类由几个核苷酸(1-5个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列,长度较短,广泛分布在染色体上。由于重复单位的次数的不同或重复程度的不完全相同,造成了SSR长度的高度变异性,由此而产生SSR标记或SSLP标记。虽然SSR在基因组上...
SSR标记介绍 simple sequence repeat 什么是SSR?短串联重复序列(Short tandem repeat, STR)=微卫星DNA( microsatellite DNA) = 简单重复序列(simple sequence repeat , SSR)长度多态性遗传标记,一般由 2-6个碱基的DNA重复序列组成,其长度多态性来源于重复单位拷贝数的个体差异。...
SSR标记的简介 SSR（simplesequencerepeat）简单重复序列（SimpleSequenceRepeat，SSR），指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA，广泛分布于基因组的不同位置，长度一般在200bp以下 SSR标记 SSR标记是一种通过直接分析遗传物质的多态性来鉴别生物内在的核苷酸排布及其外在状态表现规律的技术 SSR...