SSR标记是最常见的共显性标记,这种标记的读带方式主要有以下几种: 1.0/1数值型标记:与显性标记一样,可以转化为: 2.字母型标记:参照显性标记条带数据的记录步骤,从下往上根据确定的位点,以A、B、C……进行标记,由于二倍体的共显性标记是一对等位基因,因此从上图可知,样本1~4的条带可以转化为以下字母型的数...
简单重复序列（Simple Sequence Repeat，简称SSR），是指重复单位长度和碱基组成基本一致，只有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术。术语简介 1982年，Hamade等人发现了简单重复序列标记(SSR)技术，或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence，MS)，或短串联重复标记( ...
8. Loading buffer：去离子甲酰胺,50ml;0.5MEDTA(pH8.0),1ml;二甲苯腈cyanol,0.125g;溴酚蓝,0.125g.混匀后置于 4℃保存。9. 固定液：无水乙醇 50ml，冰醋酸 2.5ml，水 447.5ml。配制成终浓度为 10％ 乙醇，0.5% 冰醋酸的固定液。10. 染色溶液(ACS 试剂)：无水乙醇 50ml，冰醋酸 2.5ml，水 ...
SSR标记的基本原理是，根据微卫星序列两端互补序列设计引物，通过PCR反应扩增微卫星片段。由于核心序列串联重复数目不同，能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物。将这些产物进行凝胶电泳，根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。SSR标记具有一些优点，如一般检测到的是一个单一的多等位基因位点、微卫星呈共...
ISSR标记是另一种包含显性DNA序列的DNA标记。重复序列长约100-300个核苷酸。ISSR标记通过使用引物扩增，引物退火到基因组中两个相邻微卫星区域的互补序列。因此，它允许在单个实验中分析多个位点。然而，ISSR标记出现在两个微卫星重复序列之间。因此，ISSR标记允许扩增基因组中的随机DNA序列。图 2：SSR 标记 由于ISSR...
尽管微卫星 DNA分布于整个基因组的不同位置,但其两端序列多是保守的单拷贝序列,根据这两端的序列设计一对特异引物,通过PCR技术将期间的核心微卫星DNA序列扩增出来,利用电泳分析技术就可以得到其长度的多态性,此即 SSR标记的原理。 不同的基...
SSR简单序列重复标记(Simple sequence repeat,简称SSR标记),也叫微卫星序列重复,是由一类由几个核苷酸(1-5个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列,长度较短,广泛分布在染色体上。由于重复单位的次数的不同或重复程度的不完全相同,造成了SSR长度的高度变异性,由此而产生SSR标记或SSLP标记。虽然SSR在基因组上...
来自宁夏大学食品与葡萄酒学院的宋亚倩、杨波、罗瑞明*等人研究提取纯种宁夏滩羊、藏绵羊与新疆细毛羊的肝脏DNA并进行文库构建,根据文库测序结果,从3种绵羊肉基因组SSR标记入手,确定不同的候选特异DNA序列,据此设计SSR引物,采用PCR技术,用...
《NY/T1433—2014水稻品种鉴定技术规程 SSR标记法》是2014年中国农业出版社出版书籍，作者是徐群。内容简介 本标准规定了利用简单重复序列（simple sequence repeats, SSR）标记进行水稻（Oryza sativa L.）品种鉴定的操作程序、数据记录与统计、判定方法。本标准适用于水稻品种的SSR指纹数据采集及品种鉴定。本标准规定了...