SRA Toolkit(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra)是一款跨操作系统平台的(MS Windows/Linux/Mac)，用...
1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64...
访问NCBI官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),选择“Download”按钮跳转NCBI官网下载中心,在下载中心选择“Download Tools”按钮跳转工具下载中心,选择SRA Toolkit的“Download”下载按钮跳转GITHUB官网SRA Toolkit项目下载界面,选择“MS Windows 64 bit architecture”按钮(https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sd...
https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-win64.zip 安装,解压即可 配置 添加环境变量 Path bin\prefetch.exe 序列号 bin\prefetch.exe 1. 2. bin\prefetch.exe --option-file C:\SRR_Acc_List.txt 1.
windows版本的SRA Toolkit image 然后解压缩。 安装 E:\Download\sratoolkit.2.11.0-win64\bin\vdb-config --interactive 会出现以下界面 image 但是一般软件的安装程序就是自定义安装还是默认安装。为了防止各种插件出错,保险起见,选择默认。 按“default”当中标亮的字母,“f”即可。
https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64 bit architecture,直接点击就可以下载压缩文件。下载完成后,将压缩包放在软件将要安装的文件夹(文件夹路径最好不要包含中文),解压即可使用。举例来说,我们直接放在D盘下面,解压就可以 ...
之前在Linux下用SRA Toolkit下载数据效果不好,所以,果断的将它拉入了黑名单。 但是最近下载数据,用windows版本的SRA Toolkit,啊~真香~~ 1、下载 image.png 然后解压缩。 2、安装 D:\1系统软件安装包\sratoolkit.2.11.0-win64\bin\vdb-config --interactive ...
造成我在linux环境下不能使用aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi.aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi,到这个界面根据系统下载你...
The SRA Toolkit provides64-bitbinary installations for the Ubuntu and CentOS Linux distributions, for Mac OS X, and for Windows. The current binaries for: For installing on Windows: Download the zip file from the link given above Extract it to your desktop, for example ...
Windows: C:\Users\[user_name]\ncbi\public 我们可以使用SRA Toolkit(2.4以上版本支持)配置工具来改变默认的存储路径,cd命令进入bin文件夹后,输入命令./vdb-config –i出现配置界面,如下图所示: 这里只有两个主要功能:设置下载权限(Enable Remote Access)和存储目录(Enable Local File Caching),用tab键选择项目,...