正如全基因组关联研究(GWAS)的结果所揭示的,一些疾病倾向于受多位点单核苷酸多态性(SNP)之间的相互作用的影响(Moore等,2010)。已经在疾病的一些复杂性状中发现了基因之间的SNP-SNP相互作用(SSI)(Steen,2012)。 分析师认为SSI是解决遗传遗传问题的解决方案(Mackay,2014)。此外, 在遗传关联研究中必须开发有效的SSI分析...
本申请实施例提供了一种SNP‑SNP相互作用检测方法、系统、设备及介质,涉及粒子群优化技术领域,用以解决现有的SNP‑SNP相互作用检测存在时间复杂度高、优化效率低的技术问题。包括:将互信息作为目标函数,并在所有粒子的分量中分别存放一个SNP;所述互信息用于表征SNP之间相互作用与疾病表型的关联性;按照降序排列将所有...
表型受到SNP位点的影响,且位点之间存在相互作用5个回答 Phenotype by the impact of SNP loci, and the interaction between sites2013-05-23 12:21:38 回答:匿名 Table-type are SNP point is affected and the interaction between the point2013-05-23 12:23:18 回答:匿名 The phenotype receives the SNP ...
探究SNP位点对于lncRNA结构的影响 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响 除此之外,还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息,比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱,SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库的网址如下 http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP2 ...
本发明提供了一种癌症相关snp、基因、mirna和蛋白质相互作用的多层网络研究方法,包括以下步骤:1)将癌症组织样本与正常组织样本的全基因组数据进行全基因组关联分析获得snp位点数据,并从snp位点数据中筛选差异显著的snp位点数据;2)用xgboost法分别分析癌症组织样本与正常组织样本的基因表达数据、mirna数据和蛋白质数据获得差...
题目对于植物而言,固氮作用是不可或缺的自然过程,即植物将空气中的氮元素转化成其可用的形式并固定在根部。一直以来,人们认为只有配备了根瘤这种独特装备的豆科植物(如大豆、三叶草、苜蓿和羽扇豆)才能从细菌—植物共生关系中获益。然而新研究发现,固氮作用同样可以发生在树的其他部位,这一过程并不需...
[translate] aalternative disinfectants 供选择的杀菌剂[translate] a表型受到SNP位点的影响,且位点之间存在相互作用 The phenotype receives the SNP position spot the influence, also between the position spot exists affects mutually[translate]
《全基因组重测序数据高维SNP相互作用研究》是依托吉林大学，由梁艳春担任项目负责人的面上项目。项目摘要 本项目拟充分利用当前用于全基因组关联分析的基因重测序数据，通过采用基于信息熵的群智能启发搜索、基于多聚类的数据压缩、基于LASSO的高维特征选择等策略来挖掘全基因组数据中的高维SNP（核苷酸多态性）相互作用，...