正如全基因组关联研究(GWAS)的结果所揭示的,一些疾病倾向于受多位点单核苷酸多态性(SNP)之间的相互作用的影响(Moore等,2010)。已经在疾病的一些复杂性状中发现了基因之间的SNP-SNP相互作用(SSI)(Steen,2012)。 分析师认为SSI是解决遗传遗传问题的解决方案(Mackay,2014)。此外, 在遗传关联研究中必须开发有效的SSI分析...
本申请实施例提供了一种SNP‑SNP相互作用检测方法、系统、设备及介质,涉及粒子群优化技术领域,用以解决现有的SNP‑SNP相互作用检测存在时间复杂度高、优化效率低的技术问题。包括:将互信息作为目标函数,并在所有粒子的分量中分别存放一个SNP;所述互信息用于表征SNP之间相互作用与疾病表型的关联性;按照降序排列将所有...
了解SNP与体育运动之间的相互作用有助于制定个性化的运动计划,以提高心血管健康。 除了生活方式和饮食习惯,环境中的有害物质也可能与SNP发生相互作用,对心血管健康产生影响。空气污染是一个常见的环境问题,据研究表明,与特定SNP相互作用会增加心脏病和中风的风险。有毒物质如烟草烟雾中的有害物质也与特定SNP之间的相互...
探究SNP位点对于lncRNA结构的影响 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响 除此之外,还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息,比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱,SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库的网址如下 http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP2 ...
aalternative disinfectants 供选择的杀菌剂[translate] a怎么才能学好英文 How can learn English[translate] a表型受到SNP位点的影响,且位点之间存在相互作用 The phenotype receives the SNP position spot the influence, also between the position spot exists affects mutually[translate]...
本发明提供了一种癌症相关snp、基因、mirna和蛋白质相互作用的多层网络研究方法,包括以下步骤:1)将癌症组织样本与正常组织样本的全基因组数据进行全基因组关联分析获得snp位点数据,并从snp位点数据中筛选差异显著的snp位点数据;2)用xgboost法分别分析癌症组织样本与正常组织样本的基因表达数据、mirna数据和蛋白质数据获得差...
GPU3SNP是一个多GPU工具,可以详尽地分析病例对照数据集,以寻找呈现上位相互作用的3-SNP组合。 它提供了具有较高相互信息的组合的列表,该列表用作进行交互的度量。 它使用CUDA进行了并行化,可以利用同一节点/系统中的多个GPU。 (0)踩踩(0) 所需:1积分 ...
题目对于植物而言,固氮作用是不可或缺的自然过程,即植物将空气中的氮元素转化成其可用的形式并固定在根部。一直以来,人们认为只有配备了根瘤这种独特装备的豆科植物(如大豆、三叶草、苜蓿和羽扇豆)才能从细菌—植物共生关系中获益。然而新研究发现,固氮作用同样可以发生在树的其他部位,这一过程并不需...