正如全基因组关联研究(GWAS)的结果所揭示的,一些疾病倾向于受多位点单核苷酸多态性(SNP)之间的相互作用的影响(Moore等,2010)。已经在疾病的一些复杂性状中发现了基因之间的SNP-SNP相互作用(SSI)(Steen,2012)。 分析师认为SSI是解决遗传遗传问题的解决方案(Mackay,2014)。此外, 在遗传关联研究中必须开发有效的SSI分析...
本申请实施例提供了一种SNP‑SNP相互作用检测方法、系统、设备及介质,涉及粒子群优化技术领域,用以解决现有的SNP‑SNP相互作用检测存在时间复杂度高、优化效率低的技术问题。包括:将互信息作为目标函数,并在所有粒子的分量中分别存放一个SNP;所述互信息用于表征SNP之间相互作用与疾病表型的关联性;按照降序排列将所有...
[translate] aalternative disinfectants 供选择的杀菌剂[translate] a表型受到SNP位点的影响,且位点之间存在相互作用 The phenotype receives the SNP position spot the influence, also between the position spot exists affects mutually[translate]
了解SNP与体育运动之间的相互作用有助于制定个性化的运动计划,以提高心血管健康。 除了生活方式和饮食习惯,环境中的有害物质也可能与SNP发生相互作用,对心血管健康产生影响。空气污染是一个常见的环境问题,据研究表明,与特定SNP相互作用会增加心脏病和中风的风险。有毒物质如烟草烟雾中的有害物质也与特定SNP之间的相互...
本研究结果表明SNP等位基因变异和DNA甲基化修饰单独或联合作用都会影响肠道微生物群的组成和结构,并可能在后期改变个体的疾病易感性.此外,SNP等位基因,DNA甲基化修饰和肠道微生物群之间存在相互作用,并在肥胖发展中起着重要作用.这一新的证据有望在多个层面上深入了解遗传变异和DNA甲基化修饰如何影响肠道微生物群的组成...
GPU3SNP是一个多GPU工具,可以详尽地分析病例对照数据集,以寻找呈现上位相互作用的3-SNP组合。 它提供了具有较高相互信息的组合的列表,该列表用作进行交互的度量。 它使用CUDA进行了并行化,可以利用同一节点/系统中的多个GPU。 (0)踩踩(0) 所需:1积分...
aalternative disinfectants 供选择的杀菌剂 [translate] a怎么才能学好英文 How can learn English [translate] a表型受到SNP位点的影响,且位点之间存在相互作用 The phenotype receives the SNP position spot the influence, also between the position spot exists affects mutually [translate] ...
《全基因组重测序数据高维SNP相互作用研究》是依托吉林大学，由梁艳春担任项目负责人的面上项目。项目摘要 本项目拟充分利用当前用于全基因组关联分析的基因重测序数据，通过采用基于信息熵的群智能启发搜索、基于多聚类的数据压缩、基于LASSO的高维特征选择等策略来挖掘全基因组数据中的高维SNP（核苷酸多态性）相互作用，...