要画SNP的地理分布图,显而易见,主要使用的数据是SNP及其经纬度。 加载R包并读取数据,查看一下有哪些亚分类。 > library(openxlsx) > library(ggplot2) > library(maps) > snp <- read.csv('snp3kvars-LOC_OS06G03810-3594761627300423272.csv',sep = ',',header = T) > colnames(snp) #查看一下有哪些...
SNP名称 物理位置 代码 library(data.table) library(CMplot) map1=fread("re1.map",header=F) head(map1) mm=map1%>%dplyr::select(SNP=2,Chromosome=1,Position=4) head(mm) CMplot(mm,plot.type="d",bin.size=1e6,col=c("darkgreen","yellow","red"), file="tiff",memo="",dpi=300,file....
SNP在世界地图上的频率分布 简单介绍两个网页工具,第一个是GGV,其界面如下: 第二个工具是HGDP,个人感觉画出来有点丑。。都是同一所大学开发出来的;界面如下:
有两种方法,先看比较简单的一种: library(CMplot)mydata<-read.table("snp_density.csv",header=TRUE,sep=",")head(mydata)# snp chr pos# snp1_1 1 2041# snp1_2 1 2062# snp1_3 1 2190CMplot(mydata,plot.type="d",bin.size=1e6,col=c("darkgreen","yellow","red"),file="jpg",memo=...
在实现染色体SNP密度分布图的过程中,我们需要先获取SNP数据,然后对数据进行处理,最后绘制出密度分布图。具体流程如下: 教程流程 获取SNP数据 首先,我们需要获取SNP数据,可以通过数据库、文件或者API获取数据。 # 代码示例# 这里可以使用pandas库中的read_csv函数读取数据文件importpandasaspd ...
画图思路:将有SNP标记画为蓝色火柴杆图,没有SNP标记的用白色火柴杆图覆盖。 数据准备:sheet1为各染色体SNP标记的位置,sheet2为SNP标记对应的蓝色火柴杆图的线高,sheet3为SNP标记对应的白色火柴杆图的线高。 代码如下: ---代码开始了--- [n,b]=xlsread('bar18k MAF.xlsx',1);...
SNP面膜加盟投资金额:10-20万元 费用明细 所属行业: 美容养生 >护肤品 企业名称: 艾思芙化妆品(上海)有限公司 加盟人群: 自由创业,在岗投资,毕业 门店总数: 269 品牌关注: 3972 项目收藏: 3972 5844人: 觉得有用 经营范围: 面膜 总部地址 上海市闵行区吴中路1235号9楼A座 门店分布 加盟电话 ...
1、思路：将有SNP标记画为蓝色火柴杆图，没有SNP标记的用白色火柴杆图覆盖。数据准备：sheet1为各...
R 语言都是可以做的！
随风而逝的我0 学前 1 怎么使用R语言分析SNP数据,求大神帮忙。做一个SNP标记在染色体上的分布图。 留学IT硕士 高中 5 擅长c/c++/python/c#/java/r语言 /matlab/php/ 登录百度帐号 扫二维码下载贴吧客户端 下载贴吧APP看高清直播、视频! 贴吧页面意见反馈 违规贴吧举报反馈通道 贴吧违规信息处理公示...