综上所述,SMM-seq作为一种实用性强的测序技术,有望用于大规模人类基因组完整性的全面评估。该研究团队目前已申请SMM-seq专利并计划将其商业化,并将针对双重测序和其他检测方法进行广泛验证,并检测更多已知的诱变剂。与此同时,研究团队与...
本实验中对SMM-seq数据的分析显示,每个样本基因组平均约有7.7亿个位置符合识别SNV条件,相当于样本基因组的约26%。SMM-seq证实了通过单细胞方法观察到的体细胞突变频率的年龄相关升高。SMM-seq检测的突变频率在年轻组和老年组中分别为0.34±0.09和0.96±0.16体细胞SNV/1 Mbp(P=0.003)。体细胞SNV谱分析...
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送出了赞 X1 00:00 00:00 分享到:QQ空间新浪微博 Ruler子兮 卓 合作愉快 8374467 2018-04-05 19:39
SMM-seq确定真突变的算法概述 图片来源:Science Advances 用SMM-seq检测ENS诱发的SNV 作为原理证明,研究团队首先对从体外接受两种不同剂量的N-乙基-N-亚硝基脲(ENS)处理的正常人IMR90成纤维细胞中提取的DNA进行SMM-seq分析,ENS是一种有效的点诱变剂。在这里,研究团队使用亚致死剂量的ENU,不会在IMR90细胞上造成任何...