02 Smart-seq3建库基本原理 Smart-seq3既然号称能够在转录本水平研究单细胞的异质性,那么它究竟是如何达到的呢?我们首先看看其建库原理。原理图如下: 从上面的建库原理图来看,其建库方式基本上与smart-seq2一致,最大的不同在于在Tn5酶的tag后面添加了UMI序列(上图中的红色x号表示转录本的突变位点),其建库流程如下...
SMART方法的全称是Switching Mechanism at 5' End of RNA Template,该方法发表于于2012年[1],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[2],2014年Smart-Seq2 protocol发表[3]。Smart-Seq2对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: (1)TSO 3'...
生成cDNA。而smart-seq则通过直接在单个细胞中进行RNA提取和逆转录反应，生成cDNA。
Smart-seq3技术则于2020年由瑞典卡罗林斯卡学院的Rickard团队进一步改进并发表。 虽然Smart-seq技术也迭代了多个版本,但是迄今为止,Smart-Seq2是使用最多且被广泛认为更稳定的技术类型,也是国内市场众多科技服务公司推崇的技术之一。 3.1、Smart-seq2技术原理 Smart-seq2关键技术原理有: 01、MMLVRT 使用的MMLV具有链置...
技术原理 SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript)是由美国和瑞典科学家于2012年共同开发的一种单细胞转录组测序技术,其能够检测mRNA 的全长,从而实现了转录本异构分析分析和 SNV 检测。2013年,Nature Methods 杂志上报道了 SMART-seq2,该技术是经 SMART-seq 改进的一种测序方法,也是目前...
Smart-seq2技术，以其独特巧妙的逆转录策略，引领着单细胞测序领域的前沿。核心原理在于利用Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase（MMLV-RT）的神奇特性。首先，MMLV-RT在合成cDNA过程中，会在3'端随机引入几个不依赖模板的碱基，如常以胞嘧啶为主，这个看似多余的小动作，实则是科学家们获取...
Smart-seq2原理:通过设计oligo(dT)VN Primer作为逆转录引物,利用MMLVRT的模板转换活性,在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行反转录,生成cDNA第一条链。当逆转录酶到达mRNA5’末端时,会连续在末端添加几个胞嘧啶(C)残基。然后添加TSO(template-switching oligo)引物,退火后结合在第一条链的3’端与po...
MAX_RENDER_SEQ_MISSED_FRAMES:3 # 说明 时延计算受系统打点上报限制,开始时间为点击事件上报时间点,响应时延结束时间点为点击后系统响应首帧的上屏时间点,完成时延是切换后页面的首帧上屏时间点,与端到端用户感知时延存在差异。 页面切换卡顿率:目前只支持ArKUI子系统的router、navigation、tabs、swiper控件内的页面...
来源:各公司主页。从左至右分别为:Q-Nome, Gseq500. AXP100-RS 虽然,纳米孔传感技术在1996年被发明之初,其目标就是为了实现通过检测核酸序列过孔来进行DNA的测序。然而,生物纳米孔的孔道蛋白天生的脆弱性,对溶液的pH及施加的电场力都有严格的要求。此外,生物纳米孔需要插入到磷脂双分子层或特定的聚合物中作为基...