4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (http://nih.gov)进行比对,选择与靶基因特异性结合的序列进行合成即可。 上述原则是在设计siRNA时可以选择的一些参数,此外还有较为细节的原则如siRNA序列选择的位置、开始的碱基及序列及避免碱基单一...
基因沉默实验siRNA设计和转染详解汇总 一、siRNA设计 小干扰RNA(Small interfering RNA;siRNA)是一段长度在20-25个核苷酸之间的RNA双链,其生物应用较多,目前主要用于干扰RNA,达到调节基因表达(敲减)的目的,其本质是siRNA和相应的mRNA特异性结合、降解,继而实现阻滞mRNA继续翻译的目的。 设计原则: 1.siRNA序列不宜过长...
1. siRNA的设计是决定RNAi实验成败关键性的第一步。 并非每个siRNA都能有效引发基因沉默。和引物设计一样,设计有效的siRNA也有一些经过前人经验总结出的规则,而且这些规则随着对siRNA研究的深入也在不断完善之中。有一些开放的免费在线工具可用。付费的软件成功率比较高,3个保证中2个。 2. siRNA的反义链3'端最好...
2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov)进行比对,选择与靶基因特异性结合的序列进行合成即可。 上述原则是在设计siRNA时可以...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...
1.siRNA序列不宜过长,超过30nt易导致其与其他mRNA非特异性结合,一般以19-25nt之间为宜。 2.GC含量控制在35-55%之间,基因沉默效果最好。 3.siRNA序列设计的靶序列一般为目的基因的CDS序列。 4.一般siRNA需设计2-4条,另需要对照1-2条,序列设计完成后需要在BLAST中(BLAST: Basic Local Alignment Search Tool ...