单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。2013年,单细胞测序技术被《Science》将其列为年度最值得关注的六大领域榜首;2015年再次登上Science...
2017年3月,美国俄勒冈的研究人员在Nature Methods上发表“Sequencing thousands of single-cell genomes with combinatorial indexing (doi:10.1038/nmeth.4154) ”文章,开发出一种SCI-seq (single-cell combinatorial indexed sequencing,单细胞组合标记测序技术),多次对细胞进行条形码编码标记后对它们进行测序,可以同时构建...
11月加州大学圣地亚哥分校张鹍教授团队在PNAS上发表题为“Ultra-accurate Genome Sequencing and Haplotyping of Single Human Cells (doi: 10.1073/pnas. 1707609114)”的文章。开发了一个名为“SISSOR” (微流体反应器法单链测序)的方法,用来进行准确的单细胞基因组测序和单倍体分型。 正常人类单个细胞DNA含量为6.6p...
单细胞测序最初要解决的两个重要的问题是单个细胞的捕获（细胞通量）和文库的建立（微量核酸扩增）。目前...
即使是同一株细胞,百分之30融合率的状态和百分之80融合度的状态可能不一样,为了尽可能得到贴近事实的测序数据,则实验的把控则相当重要。细胞培养尚且算是容易的,动物样本的采集过程中可能会引物非常多的变量。例如:动物死亡后是否能及时取样,不同动物取样时的手法力度是否一样,取样后是否及时进行了下一步操作,操作...
很高兴借助知乎平台,总结并分享自己的关于单细胞测序技术的学习笔记,欢迎知友们能够一起探讨问题。希望在大家的帮助与建议下,能够分享出全知网最优秀的文章来总结技术。为了区别现在的文章思路(翻译),我的写作风格将是问题与回答式写作,启发大家对于科学问题的思考。码字与总结不容易,也希望大家能够多多支持点赞,鼓励我...
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Single-cell sequencing provides analysis of thousands of individual cells within complex environments, as opposed to traditional bulk sequencing methods that only provide a representative average of all cells. With developments in microfluidics and molecular barcoding, NGS-based technologies have increasingly...
单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术作为一项革命性工具,在单细胞水平上对转录组进行分析,已经被广泛用于多个方面的生物医学研究,包括肿瘤异质性研究、新细胞类型的鉴定、组织发育与细胞分化过程研究和基因调控网络研究等。通过scRNA-seq获得高通量的单细胞转录组数据后,利用原位组织学验证是目前流行...
复现原文(一):Single-cell RNA sequencing of human kidney(step by step),Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程(原理、代码和评述))