另外,这项研究的一个创新之处在于结合了两种高通量单细胞技术:基于微流体的单核测序 (snDrop-seq) 和单细胞转座子超敏感位点测序 (scTHS-seq)的方法。snDrop-seq,不仅可以对成千上万个单细胞同时进行转录组分析,从多方面对细胞类型和细胞状态进行分类,还可用于评估新鲜和冻存人体组织中的特异性表达谱,有助于...
为了验证鉴定小鼠interneurons的Dlx1/2调控网络,作者分析了人脑的sNuc-Seq(Single nuclei RNA-Seq)数据集。 在人类脑sNuc-Seq数据集上,SCENIC也鉴定出由DLX1/2强烈驱动的interneurons细胞群,该群具有与小鼠相同的motif,并且识别出一组保守的靶标,包括DLX1本身。 接下来,作者将这种跨物种分析扩展到其他细胞类型。与基...
SORT-Seq Single-cell transcriptomics method utilizing 384-well plates, ideal for low cell counts, FACS sorted populations, and pilot projects. Developed by our founder, exclusively offered by us. 10x Genomics Certified Service Provider of the 10x Genomics Single Cell Gene Expression and Single Cell...
可以用于存储scRNA-seq数据。它的一个优点是能够将计数矩阵和所有元数据存储在单个文件中，而不是使用特...
以改善我们对肿瘤生物学，肿瘤微环境和治疗反应的理解，并且scRNA-seq即将被用于改善临床决策。
10月,Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章,提出了一个新的测序技术:DroNc-Seq单细胞表达谱分析技术。该技术融合了sNuc-Seq技术与微流控技术的单细胞核RNA测序方法,可以在结构复杂的组织中更有效地分析...
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物生物...
Characterization of the single-cell transcriptional landscape by highly multiplex RNA-seq. Genome Res. 21, 1160–1167 (2011). The first demonstration of highly multiplexed single-cell RNA-seq showing that cell types can be distinguished in an unbiased manner on the basis of unfiltered single-cell...
使用single-cell RNA-seq能够从海量的单细胞数据中揭示组织中不同细胞类型,以及同一细胞中不同基因的表达情况。这篇文章通过单细胞RNA-seq构造了小鼠雄性生殖细胞分化发育的表达动态图谱,揭示了关键调控因子,并且提供了一种分离最后阶段圆形精子的表面标...
单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术作为一项革命性工具,在单细胞水平上对转录组进行分析,已经被广泛用于多个方面的生物医学研究,包括肿瘤异质性研究、新细胞类型的鉴定、组织发育与细胞分化过程研究和基因调控网络研究等。通过scRNA-seq获得高通量的单细胞转录组数据后,利用原位组织学验证是目前流行...