run-trust4 -f hg38_bcrtcr.fa --ref human_IMGT+C.fa -u path_to_10X_fastqs/*_R2_*.fastq.gz --barcode path_to_10X_fastqs/*_R1_*.fastq.gz --readFormat bc:0:15 --barcodeWhitelist cellranger_folder/cellranger-cs/VERSION/lib/python/cellranger/barcodes/737K-august-2016.txt [other ...
www.nature.com/mi ARTICLE Single-cell TCR sequencing of gut intraepithelial γδ T cells reveals a vast and diverse repertoire in celiac disease Linn M. Eggesbø1, Louise F. Risnes1,2, Ralf S. Neumann1, Knut E. A. Lundin1,3, Asbjørn Christophersen1 and Ludvig M. Sollid1,2 A ...
例如CellMarker（28），PangaloDB（29）和ImmuCellDB（30），它们利用通过文献手工核查确定的特定于细胞类...
为了克服上述挑战，上海懿贝瑞提出了利用单细胞RNA测序（Single-Cell RNA-Seq）技术来发现肿瘤突变抗原特异性TCRs的新方法。单细胞测序能够揭示每个细胞的独特变化，甚至揭示全新的细胞类型，极大地推进了基因组学领域的发展，使科学家们可以在单细胞水平上进行分子机制研究。这一方法通过分离患者TILs，与来源...
When compared to uninfected cells, the TCR repertoire of reservoir cells is heavily biased: expanded clonotypes are present in all individuals, account for the majority of reservoir cells and are often maintained over time on ART. Infected T cell clones are detected at low frequencies in the ...
Of these valid cells, 23% (776/3325) had dual productive TCRγ receptors and 1.2% (39/3325) had dual productive TCRδ receptors. After collapsing of expanded clones into unique T-cell clonotypes, 1542 clonotypes remained. The intraepithelial TCRγ and TCRδ chain usage is altered in CeD ...
TCR/BCR 蛋白质 CRISPR 用于具有成本效益的研究 每次运行最多 160,000 个细胞(1-8 个样本 产品 通用型 3' 基因表达 通用型 5' 基因表达 Flex基因表达 按照您的日程表进行固定、分批和运行。 基于探针的化学方法 在低质量样本和FFPE样本上表现出色
T cell affinity in these assays is not equivalent to T cell efficacy (i.e., how effectively the TCR-pMHC interaction activates T cells)11,12. As TCR efficacy is a crucial criterion for clinical applications of TCR therapy, there is a critical unmet need to develop TCR selection technologies...
scRNA-seq 是单细胞测序技术,这个技术测量单细胞的表达谱,有利于对细胞进行分类 TCR-seq 对T细胞有特有的TCR区域进行测序可以追踪T细胞的来源,也就是克隆情况,正常情况下,每个T细胞的TCR都是不一样的,但是在外界刺激的情况下,某些T细胞会选择性扩增,这个时候克隆产生的T细胞的TCR就是一样的。
TCR/BCR 抗原特异性 独特的样本制备能力 更多实验选项 基因表达 覆盖全转录 通过捕获mRNA转录本的3’或5’端分析整个转录组,对多个物种的细胞类型和状态进行无偏表征。 兼容的样本类型 细胞悬液、细胞核悬液、流式分选的细胞、固定的人类PBMC、新鲜组织、冷冻组织、DSP/甲醇固定的组织、类器官 产品 通用型3’基因...