1.2 格式转换与信息统计SeqKit的转换功能强大,如 fa2fa命令可快速将FASTQ转换为FASTA,而 fx2tab则可以统计碱基含量、长度、ID等信息。通过 stat和 stats命令,你可以分析序列长度分布、四分位数、N50等统计数据。1.3 从ID提取序列和motif定位SeqKit的 grep命令允许你根据ID、正则表达式或特定模式精准提...
root:~/refs# seqkit stat duplicated-reads.fq.gz 1.取序列名 seqkit fx2tab -n -i duplicated-reads.fq.gz | head 2.查看gc含量 seqkit fx2tab -n -i -g duplicated-reads.fq.gz | head 3.查看序列中任意碱基(或组合)的含量 seqkit fx2tab -n -i -B A -B T duplicated-reads.fq...