这种进阶版seqFISH技术显著提高了编码容量,仅需四轮成像,即可完成全基因组的超分辨成像。在具体实现上,seqFISH+首先利用一系列长度约100nt的探针进行全RNA标记,每个基因通过这些探针进行识别。通过轮次编码,每轮编码信息对应不同的荧光通道,实现精细的成像。最终,seqFISH+技术仅需一台共聚焦荧光显微镜,...
最终利用这种编码技术,仅仅需要一台共聚焦荧光显微镜就可以实现‘super resolved’的10000种基因的超多元成像。 seqFISH+原理示意图 下面两张图是分别对细胞和组织切片做的RNA成像,可以看到大多数RNA的分布都很聚集,但采用seqFISH就可以很好地解决optical crowding的问题。 seqFISH+用于细胞与生物组成切片中转录组的超分辨...
作者首先利用seqFISH技术对浮游状态下不同生长期铜绿假单胞菌的生长指标及105个基因的表达进行了监测,发现同时监测需要两天的成像时间,而对不同样本进行顺序监测则需要耗费约3周时间。作者因此对seqFISH技术进行了改进,设计了一种靶向16s rRNA的一级探针Ribo-Tags,利用该探针和基因探针对混合后的样本进行并行(...
Nat Biotechnol | USeqFISH:用于生物组织中病毒载体趋向性分析的空间转录组学技术 华大时空 已认证账号来自美国加州理工学院的研究人员开发了一种高度灵敏的空间转录组学技术——超灵敏序贯荧光原位杂交(ultrasensitive,sequential fuorescence in situ hybridization,USeqFISH),可实现完整组织中内源性和病毒RNA的空间...
来自美国加州理工学院的研究人员开发了一种高度灵敏的空间转录组学技术——高灵敏序贯荧光原位杂交(ultrasensitive,sequential fuorescence in situ hybridization,USeqFISH),可实现完整组织中内源性和病毒RNA的空间转录组分析。利用USeqFISH,研究人员揭示了腺相关病毒(adeno-associated viruses,AAVs)载体突变体在小鼠大脑区域...
作者首先利用seqFISH技术对浮游状态下不同生长期铜绿假单胞菌的生长指标及105个基因的表达进行了监测,发现同时监测需要两天的成像时间,而对不同样本进行顺序监测则需要耗费约3周时间。作者因此对seqFISH技术进行了改进,设计了一种靶向16s rRNA的一...
2月23日,$Fulgent Genetics(FLGT)$宣布对序列荧光原位杂交(seqFISH)技术的开发商Spatial Genomics进行战略投资。 FLGT投资金额高达4000万美元,领投Spatial的A轮融资,该轮融资总额约为5600万美元,还包括12家WestCapital和其他投资者的投资。 Fulgent还与Spatial达成商业协议,将seqFISH技术集成到FLGT的基因组测试平台中。