在测mRNA的过程当中,首先要解决的问题,就是如何去除核糖体RNA,即rRNA”(Ribosomal RNA)。 在通常抽提到的总RNA中,绝大部分都是核糖体RNA(rRNA)。以人类的细胞或组织为例,一般抽提到的总RNA当中,95%都是核糖体RNA。剩下的2%到3%是mRNA。还有2%到3%是Long non-coding RNA、或者tRNA、microRNA这些RNA。也就是...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
介绍Watchmaker 公司的低起始量、低质量 RNA 样本的 RNA-seq 测序建库试剂盒。 这个试剂盒通过优化酶、接头、操作流程等一系列改进,做到了能够对低起始量、低质量 RNA 样本(包括从 FFPE 石蜡样本中回收的 RNA)进行RNA-seq 测序建库的目的。并且能够得到良好的测序结果。 字幕内容 今天我要给大家介绍 watchmaker 公...
RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和非编码RNA(ncRNA),用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。🚀 高通量测序技术 高通量测序技术(High-throughput sequencing),也称为“下一代”测序技术(Next...
RNA-seq实验流程图 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2.RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA; (2) 加入Fragmentation Buffer将mRNA进行随机打断; ...
转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或...
为单细胞准备全长文库与在Bulk RNA测序中所做的基本相同,并且仅限于基于微孔板的方法,如SMART-seq2。尽管理论上全长方法应该提供均匀的转录本覆盖,但有时整个基因体的覆盖可能会存在偏差。全长方法还允许检测可变剪接体,这对于其他方法来说很难做到。
用RNA-seq打开重测序样本,快速发掘性状关联基因? 常规GWAS分析,众所周知,是分析遗传变异(genotype, 如SNP)与表型(phenotype)之间的关联。但一般来说,基于GWAS的结果,仅能给出候选的染色体区域,无法确切定位与表型直接相关的候选基因。 全转录组关联分析(TWAS)作为一种可以直接检测基因-性状的关联性,从而更快发掘与...
第二代测序技术（Short Read RNA-seq）第二代测序技术在测序方法上取得了重大突破，基于“边合成边测序”（sequencing by synthesis）和大规模平行测序技术（massive parallel analysis,MPS），使测序通量和读取速度得到极大提升，其中最具代表性的是Illumina Solexa测序仪。Illumina的测序原理可以简化为四步：样品文库构建...