综上，癌细胞的异常增殖和分化是前列腺癌形成和发展的核心，ScRNA-seq和ST-seq可以被用来分析前列腺癌和肿瘤微环境的异质性。将ScRNA-seq和ST-seq与蛋白质组学和代谢组学等多组学技术相结合，将有助于更全面地理解前列腺癌复发和转移的分子机制，以期发现更多与治疗耐药性相关的分子靶点，实现更有效的治疗方案和更好...
scRNA-seq的关键应用之一是基于细胞聚类或分类来确定细胞亚群。NMF被用于在单细胞转录组数据中分离亚群,并已被证明以更高的准确性和鲁棒性优于PCA。同样的,开发SinNLRR是为了通过非负和低秩表示提供强大的基因表达子空间聚类。 最先进的聚类方法,如k-means算法,也已应用于scRNA-seq数据集,并基于此应用,开发了SC3方法。
目前较为常用的单细胞转录组测序(single cell RNA sequence,scRNA-seq)技术是在2009年由Tang等[2]首次提出的。经过近10年的发展,单细胞转录组学也产生了很多新的技术,如以单细胞标记反转录测序(single-cell tagged reverse tranion sequencing,STRT-seq)、细胞表达线性扩增和测序(cell expression by linear amplific...
以上研究结果表明,scRNA-seq数据与临床结果高度相关,并有可能作为MM,特别是PRMM患者的辅助诊断,应用到临床治疗中。 图5.广泛耐药的MM患者的分子通路 5. MM患者治疗响应的纵向单细胞克隆动力学 在临床试验中,除了无应答患者以外,也有一些患者存在后期复发的情况。克隆进化是肿瘤进展和耐药的主要驱动力,研究人员通过对...
一项研究通过单细胞转录组测序（scRNA-seq）分析，揭示了MM耐药机制。研究对41例难治性MM患者、15例新诊断MM患者和11名健康人进行测序。结果显示，难治性和耐药MM患者存在独特应激通路，包括缺氧耐受、蛋白质折叠和线粒体呼吸。此外，PRMM患者的基因特征可预测KYDAR治疗的临床响应。研究还分析了广泛耐药MM...
组学技术:scRNA-seq 胸主动脉瘤及夹层(TAAD)是一种危及生命的疾病,其特征是胸主动脉内层变性。彻底了解发病过程中调节因子的变化对临床治疗的发展至关重要。为了描述TAAD发展过程中的细胞和分子变化,本研究在从疾病早期到晚期的三个时间点对β-氨基丙腈诱导的TAAD小鼠模型的胸主动脉细胞进行了单细胞RNA测序。进行了...
②从Tabula Muris和Tabula Sapiens图集中采样数据,创建了具有一系列数据属性的scRNA-seq数据集,并评估了传统和基于深度学习的特征选择方法在细胞类型分类、特征选择的可重复性和多样性以及计算时间方面的性能。 ③ 该研究为未来开发和应用基于深度学习的特征选择方法进行细胞组学数据分析提供了参考。
scRNA-seq单细胞测序技术可对分散的单个细胞分别进行基因组、转录组、表观遗传组或多组学测序,可从较少的肿 瘤细胞中获得取可能多的信息。其过程和原理,首先就是给一个bead表面合成无数含有polyT的反转录引物(一个磁珠上含有的polyT引物数量可以高达10的8次方个),然后将每一个磁珠和一个单细胞通过微流控技术放到...
内容概要:介绍了scRNA-seq技术的基本过程和发展,并探讨了其在癌症研究和临床实践中的应用。癌症是一组异质性疾病,scRNA-seq技术可以帮助我们理解肿瘤异质性和肿瘤微环境,从而更好地了解肿瘤发生、进展、转移和药物耐受性的机制。 2、内源性腺嘌呤介导糖尿病模型的肾损伤并预测患者的糖尿病肾病 ...