图4| scATAC-seq 技术流程图 4、 单细胞DNBelab C4技术平台优势 单细胞 DNBelab C4 技术平台基于高通量单细胞建库系统 DNBelab C4,联合自主研发的 DNBSEQ 超高通量测序系统,可以实现单次测序数据产出规模达百万级细胞,可用于检测 scRNA-seq 及 scATAC-seq,在大幅降低建库成...
scRNA-seq数据的有效维度比所有可能的基因表达组合模式所允许的维度更低,部分原因在于scRNA-seq数据的视野有限:例如,对于描绘某一只有三个主要细胞类型的组织来说,大多数转录改变只需要用2个捕获细胞类型间差异的轴即可解释。根本上,更低的有效维度反映了细胞中基因调控逻辑所带来的转录协同性。例如,当10个基因受同一...
单细胞RNA测序,通常简称为scRNA-seq,是一项革命性的生物技术,已经改变了我们对生命科学的理解方式。这项技术使研究人员能够深入了解单个细胞的基因表达模式,揭示了生物体内的细胞异质性和功能多样性。在本文中,我们将探讨单细胞RNA测序的意义以及它在生物研究中的应用。 一、单细胞RNA测序是什么? 单细胞RNA测序是一种...
1、进行技术改进后,Smart-seq2利用现成的试剂能生产更高质量的文库,且成本也有所下降,为分析大量细胞提供了可能性。 2、Smart-seq2的方案组分和原理是公开的,让研究人员可以进一步对其进行改良,目前在这个方案基础上涌现了许多单细胞测序的新成果。 它的缺陷是:建库过...
与scRNA-seq相比,snRNA-seq技术具有以下几个优势:可以减少细胞捕获过程中因细胞大小不同等因素造成的不同细胞类型比例出现偏差的问题;减少酶解过程对细胞转录的影响;可以使用冷冻样本。其局限性主要在于细胞质遗传信息的丢失。 参考文献 An optimized FACS-free single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) method for pla...
因此,高深度、低通量的scRNA-seq方法在区分转录相似的神经元亚型甚至状态方面具有独特的优势。在这项研究中,再生和非再生CST神经元之间的差异基因表达反映了不同的再生状态,而不是神经元亚型。进一步阐明高深度、低通量的scRNA-seq方法将继续补充低深度、高通量方法,以了解新的生物学。
起源自Drop-Seq技术 横向孔道逐个导入凝胶微珠Gel beads,第一个纵向道输入细胞 当凝胶微珠和细胞碰撞会被吸附在微珠上,然后通过微流控技术运送到第二个纵向通道(“油管”)。这时就会形成一个个的油滴GEMs(一个油滴就是一个凝胶微珠,也就是一个单细胞),然后收集在EP管中 每一个凝胶微珠都布满了不同的Barcod...
B.单核细胞测序（snRNA-seq）目前来说的优势/劣势：1.优势：避免解离偏差（细胞类型偏好）2.优势：...
对肿瘤发育点的基质隔室内黑色素瘤和引流淋巴结(LNs)进行scRNA-seq,来自LNs的幼稚淋巴细胞在PD1和Lag3表达之前在肿瘤内经历激活和克隆扩增,而肿瘤相关骨髓细胞促进抑制性生态位的形成。在早期肿瘤中观察到“免疫”基质细胞,但“收缩”细胞在以后的时间点变得更加普遍。补体成分C3在免疫群体中特异性表达。其裂解产物C3a...