1. 样本来源不同： scRNAseq：直接对单个细胞进行RNA提取和测序，能够获取整个细胞的转录组信息。 snRNAseq：仅对单个细胞的细胞核进行RNA提取和测序，主要反映细胞核内的转录组信息。2. RNA含量与检测效率： scRNAseq：由于是从整个细胞中提取RNA，因此RNA含量相对较高，能够检测到更多的基因。 sn
scRNA-seq和snRNA测序可以使用相同的Seurat流程，但是QC指标需要不同 2.scRNA-seq和snRNA-seq即使通过整...
从细胞分析结果上看,snRNA-seq可以能够减少酶解过程人为诱导的假细胞类群的产生,且针对在解离时容易死亡的细胞,用snRNA-seq也更合适。 虽然snRNA-seq有以上优势,但并不意味着snRNA-seq就可以完全替代scRNA-seq,首先snRNA-seq检测的是细胞核中的RNA,检测到的RNA数量还是少于整个细胞可以检测到的数量;其次对于某些细胞...
scRNA-seq和snRNA-seq是两种常用的单细胞测序技术,它们在实验设计、样本处理和数据分析等方面存在一些区别。 一、定义和原理: 1.scRNA-seq(Single-cell RNA sequencing)是一种用于测定单个细胞中RNA分子的技术。它通过将单个细胞的RNA转录本进行扩增和测序,从而获得单个细胞的转录组信息。
体积和单细胞RNA-seq之间的主要区别在于,每个测序文库代表单个细胞,而不是细胞群。因此,没有办法在单细胞水平上进行“生物复制”:每个细胞都是独一无二的,不可能复制。相反,可以通过它们的相似性对细胞进行聚类,然后可以在相似细胞组之间进行比较。 单细胞RNA-seq的另一个重大挑战是每个细胞的起始材料量非常低。这导...
【1】Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据收集与预处理 文献解读 TCGA、GEO公共数据下载 差异表达基因分析 富集分析 【翰佰尔生物】, 视频播放量 2573、弹幕量 0、点赞数 99、投硬币枚数 53、收藏人数 372、转发人数 31, 视频作者 翰佰尔生物, 作者简介 官网:henbio.com/tools |
在单细胞研究的舞台上，scRNA-seq（单细胞RNA测序）与snRNA-seq（单核RNA测序）像是两把利剑，各自瞄准不同的挑战。scRNA-seq因其广泛的应用范围和基因丰富度而备受瞩目，但冻存样本的处理对其结果影响显著。相比之下，snRNA-seq通过关注细胞核转录，巧妙地绕过了解离和转录偏差，尤其适合冻存样本，却牺牲...
文章摘要:单核 RNA 测序 (snRNA ‑seq) 是 一种用于分析细胞中基因表达的方法 分离是复杂的,例如在肝细胞癌中 (HCC) 组织。它构成了单细胞 RNA 的替代品测序(scRNA-seq)通过分析细胞核而不是整个细胞;但是,是否可以完全替代 HCC 中的 scRNA-seq 仍有待阐明。
scRNA-seq技术在捕捉细胞间的细微差异上展现出了巨大的潜力，而bulk RNA-seq则为我们提供了宏观的生物学景观。理解这两者之间的区别，是进入单细胞分析领域的第一步。在单细胞捕获和准备过程中，传统的人工操作与现代自动化技术并存。从使用手动移液器到自动化移液系统如流式细胞仪，技术的进步不仅提升了...