基于无监督聚类分析,scFFPE-seq数据的分析产生了17个分离良好的聚类,每个细胞鉴定的基因中位数为1480个。Visium数据产生了17个空间聚类(恰好与scFFPE-seq数据的聚类数量相同),每个点识别的基因中位数为5712个。 研究人员基于上述两个数据集和现有的人类乳腺癌参考文献,对scFFPE-seq聚类进行了注释(图2a),将细胞类型...
首先们利用 scFFPE-seq 数据将三种不同的肿瘤上皮细胞亚型和两种肌上皮亚型映射到 Xenium 数据中。选择了三个感兴趣区(ROI):DCIS #1、DCIS #2 和浸润性肿瘤(图 4a)。使用 scFFPE-seq 数据确定了 Xenium 数据中 ROI 内 15 种细胞类型的比例,包括淋巴细胞、巨噬细胞、基质细胞、肌上皮细胞和侵袭细胞。可确定...
基于无监督聚类分析,scFFPE-seq数据的分析产生了17个分离良好的聚类,每个细胞鉴定的基因中位数为1480个。Visium数据产生了17个空间聚类(恰好与scFFPE-seq数据的聚类数量相同),每个点识别的基因中位数为5712个。 研究人员基于上述两个数据集和现有的人类乳腺癌参考文献,对scFFPE-seq聚类进行了注释(图2a),将细胞类型...