图1 scFEA分析流程 scFEA以代谢重构图作为因子图,基于网络优化求解来捕获转录组到代谢组之间的复杂信息关联,使用多层神经网络来降低酶基因表达和反应速率,从而实现细胞代谢通量的计算。其基本计算框架由预先定义的人类代谢图谱,结合网络拓扑因子图、显著非零基因表达及用户自定义输入的次级网络作为输入,利用通量平衡分析重...
scFEA 包括三个主要的计算部分,即:(1) 网络还原和重建,(2) 估计细胞的代谢通量,(3) 下游分析,包括代谢压力的估计,代谢基因的扰动,以及不同代谢状态的细胞聚类。scFEA 的必要输入是 scRNA-seq 数据集,而可选的输入,包括细胞组标签或感兴趣的代谢反应子集,可以指定用于额外的分析。 在scFEA 中,开发者首先对从...
这次要介绍的scFEA(单细胞通量估计分析)也是基于单细胞转录组进行分析的。scFEA由人类代谢图谱作为重点代谢模块、利用scRNA-seq数据通量平衡约束的新型概率模型和基于图神经网络的新型优化求解器提供支持。利用多层神经网络捕获了从转录组到代谢组的复杂信息级联,以服从酶基因表达与反应速率之间的非线性依赖关系。具体原理感...
scFEA同样是基于已有的一些代谢相关的功能通路,不过作者将代谢图谱中的网络图案被简化为代谢模块,其中反应和代谢物用黑色和蓝色的矩形表示,模块和代谢物用绿色和粉色表示。 image.png 随后作者用已知的细胞代谢情况的数据集对scFEA的分析结果进行验证。 image.png 最后作者还将scFEA应用于两个肿瘤scRNA-seq数据集,ROS...
高职院校学生常见心理障碍分析及对策 根据Symptom Check list-90(简称SCL-90测试)结果看,高职院校学生在强迫症,忧郁,焦虑,敌对,偏执和精神病性等因子上和全国常模比较,存在显著差异,并且高于全国常模平均... 张忆平 - 《黄河水利职业技术学院学报》 被引量: 0发表: 2...
摘要: 对97例成人正畸患者进行了分析.结果:采用活动矫治器完成矫治加上好转共占97%;拔牙减数法矫治33人,完成及好转共32人,效果肯定.着重讨论了成年人正畸的特点及正畸治疗与义齿修复相互结合的问题.认为成人正畸对不要求改变整个颌骨的形态和位置,不太严重的错(牙合)畸形,年龄18~45岁者均适合.关键词:...
在临床实习过程中,静脉穿刺是最常见的护理操作之一,其穿刺成功与否,直接影响到患者的抢救和治疗,以及对实习护生的信任感。笔者通过对近两年来在我科实习的108名护生静脉穿刺失败的原因进行分析, 展开 关键词: 实习护生 静脉穿刺失败 原因分析 年份: 2011 ...
糖尿病肾病同型半胱氨酸水平与炎症因子的相关性分析 目的检测糖尿病肾病患者的同型半胱氨酸水平(Hcy)与炎症因子水平,并分析Hcy与炎症因子间的关系.方法随机抽取2015年5月—2017年5月期间到该院就诊的60例2型糖尿病肾病患... 李...
野生乌饭树浆果营养成份分析及其利用价值 乌饭树(Vaccinium bracteatum Tbunb.),杜鹃花科,越桔属。别名:羊尘饭,十月乌,珍珠花,乌饭子。常绿灌木,多分枝,叶互生,革质。浆果球形,熟时紫黑色,味甜,可食。我国南北... 许彬,郑光耀,翟其骅,... - 《中国野生植物》 被引...
为研究某变电站一起220 kV电容式电压互感器铁磁谐振故障的原因,通过对220 kV电容式电压互感器的结构原理、内部稳态谐振、暂态谐振及其抑制措施进行了探讨,在分析了电容量、介质损耗、录波图后,初步判断该电容式电压互感器出现铁磁谐振且... ...