scfea是“Supply Chain Financial Engineering Analysis”的缩写,即供应链金融工程分析。这是一种涉及供应链、金融和工程学领域的综合性分析方法,旨在通过优化供应链金融结构和流程,提高供应链的效率和可持续性。 为什么需要scfea? 在传统的供应链管理中,金融因素往往被忽视或较少关注。然而,供应链的运作和发展离不开...
除了运行完整的代谢模型外,也可以选择运行部分模型,scFEA也提供了很多特定的子模型,例如运行谷氨酰胺分解(glutaminolysis)模型,只需要将moduleGene替换为module_gene_glutaminolysis1_m23.csv,将stoichiometry替换为cmMat_glutaminolysis1_c17_m23.csv: python src/scFEA.py --data_dir data --input_dir input \ --...
单细胞代谢分析我们之前分享过,例如基于scmetabolism包的,本质是对基因集合的评分。这次要介绍的scFEA(单细胞通量估计分析)也是基于单细胞转录组进行分析的。scFEA由人类代谢图谱作为重点代谢模块、利用scRNA-seq数据通量平衡约束的新型概率模型和基于图神经网络的新型优化求解器提供支持。利用多层神经网络捕获了从转录组到...
scFEA(Single-cell Flux Estimation Analysis)是一种专门用于分析单细胞代谢网络的方法。它通过推断单细胞的代谢通量(fluxes)来揭示细胞代谢活动。scFEA的结果通常包括几个输出文件,其中balance.csv和flux.csv是重要的结果文件,它们分别提供了代谢平衡和代谢通量的信息。 1.balance.csv文件 balance.csv文件包含了每个细胞...
SCFEA算法基于左联合构筑嵌入模式,通过分析代谢网络的拓扑结构和代谢物的转化关系来推断关键反应路线和代谢物。其主要步骤包括: (1)构建代谢网络:从已知的代谢物数据库中构建代谢网络,将代谢物作为节点,将代谢反应作为边连接。 (2)计算节点权重:根据代谢物在代谢网络中的出现次数和连接关系,计算节点的权重。权重反映了...
release scFEA sampling and fitting function for large dataset. For dataset which contains more than 10,000 single cells, the general pipeline is too time comsuming to get the result without a GPU acceleration. Instead, user should use sampling function to extract subset of cells for each cell...
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scFEA: A graph neural network model to estimate cell-wise metabolic flux using single cell RNA-seq data 来自 ResearchGate 喜欢 0 阅读量: 493 作者: N Alghamdi,W Chang,P Dang,X Lu,C Zhang 展开 摘要: The metabolic heterogeneity, and metabolic interplay between cells and their ...
SCFEA 2013 8694次下载 相似应用,小编亲测可用 PDF阅读器 40.29MB 查看 Excel 35.46MB 查看 备忘录 10.95MB 查看 WPS Office 146.1MB 查看 SC Festival & Event Conference app to be held January 19-21, 2013 in Charleston, SC.Meeting app features include:-Program: Browse the event program ...
光纤法兰盘SC-FC方转圆连接耦合器适配器电信级光纤法兰头单工 价格 ¥191.00 ¥51.00 起订量 10起批 10起批 发货地 广东 广州 颜色分类 塑料50个电信级<0.2db 51.00元 金属50个电信级<0.2db 97.00元 塑料100个电信级<0.2db 85.00元 金属100个电信级<0.2db 191.00元 所属类目 电子元器件;光电...