前面我使用 ArchR 软件的官网默认流程跑完GSE173682这个数据分析后,发现数据的降维聚类结果umap没有文献中那样分得开,对于没有什么项目经验的初学者来说,单单跑标准代码肯定是不够的,现在来学习一下这个数据的文献中提供的代码。 前面分析的过程见:(IF=14.5)11个高分杂志的scATAC-seq数据分析实战:GSE173682 数据