研究人员通过分析细胞中存在的所有RNA，从数量上证明了感染细胞RNA的变化，并通过在地图上定位核苷酸中每个区域的甲基化数量，从质量上证明了感染细胞RNA的变化。该研究是2021年发表的早期基因组分析的延续，研究人员分析了SARS-CoV-2中的甲基化模式。"甲基化在病毒中具有两种功能。它调节蛋白质的表达，并且它能防御干...
2020年4月9日,来自首尔大学/韩国基础科学研究院 (Institute for Basic Science) RNA研究中心Narry Kim和Hyeshik Chang团队在Cell杂志上以“pre-proof”形式在线发表了关于SARS-CoV-2的最新研究成果——“The architecture of SARS-CoV-2 transcriptome”。 文章报道了SARS-CoV-2病毒的转录组及RNA修饰,为研究病毒的...
图1. 纳米孔RNA直接测序和DNA纳米孔测序结果——感染的细胞中SARS-CoV-2病毒RNA和宿主mRNA所占的比例 SARS-CoV-2作为一种正义单链RNA病毒,在自身编码的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRP)的作用下,能够合成全长的反义RNA链。利用反义RNA链作为模板,可以进一步产生正义基因组RNA (positive-s...
在HCV ns5b延伸复合物或它与二磷酸索非布韦(pp-sofosbuvir)形成的复合物的结构中,一个关键的特征是整合到RNA链上的二磷酸索非布韦与N291(相当于SARS-CoV-2中的N691)相互作用,但由于它的糖基上发生氟取代,它不能与S282和D225连接...
其中的一个关键组分---RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp, 也称为nsp12)---催化病毒RNA合成,因而在SARS-CoV-2的复制和转录周期中起着至关重要的作用,它在这个过程中可能需要作为辅因子的nsp7和nsp8的协助。因此,nsp12被认为是瑞德西韦(remdesivir, 也称为GS-5734)等核苷酸类似物抗病毒抑制剂的主要靶点,其中瑞德西韦已...
sars-cov-2是一种带包膜的正义单链rnaβ冠状病毒,属于冠状病毒科。针对sars-cov-2基因组rna(grna)的核酸检测方法有助于covid-19的早期诊断和控制。 目前,最常用的诊断方法,包括定量逆转录pcr(rt-qpcr)检测病毒基因组核酸片段,无法区分样本是来自有复制活性sars-cov-2,抑或仅仅是病毒基因组rna碎片。这种局限性...
为了检测肺组织中SARS-CoV-2病毒的复制,研究人员通过设计不同的探针分别靶向SARS-CoV-2正链RNA(所有病毒)与负链RNA(复制中病毒),通过RNAscope的方法检测了感染的恒河猴肺组织中的病毒正义链和反义链的分布状态,揭示了肺组织中SARS-CoV-2病毒的复制的原位信息(见下图,病毒阳性信号为图中的红色信号点)。
SARS-CoV-2的N蛋白是充足的RNA结合蛋白,对病毒基因组的包装至关重要。然而目前此过程的分子机理仍不清楚。来自华盛顿大学的Holehouse与Soranno课题组于Nature Communication合作发表题为“The SARS-CoV-2 nucleocapsid protein is dynamic, disordered, and phase separates with RNA”的文章,通过单分子荧光以及模拟揭示...
作为一种RNA病毒,SARS-Cov-2进入宿主细胞复制基因组RNA并产生许多较小的RNA(称为亚基因组RNA)。这些亚基因组RNA用于合成SARS-Cov-2开始所需的各种蛋白质(刺突蛋白、囊膜蛋白等)。因此,较小的RNAs是破坏新冠状病毒攻克我们免疫系统的好目标。尽管最近的研究报告了RNA基因组序列,但只预测了基因的可能位置,具体定位...
专家开发了一种基于三重形成探针技术检测RNA病毒的新方法。这种创新方法为检测SARS-CoV-2、甲型流感病毒(H1N1)或呼吸道合胞体病毒(RSV)等病毒开辟了新的选择,呼吸道合胞体病毒是一种影响新生儿的病原体,需要仔细鉴别诊断。 欢迎领取赛默飞细胞器染料/荧光探针选择指南,查找适用的细胞器特异性抗体和细胞器染色剂详细...