作为一种RNA病毒,SARS-CoV-2的突变率相对较高,导致其基因组内变异丰富。在过去的一年里,SARS-CoV-2病毒株中检测到了超过2万个突变(包括一些插入和删除),其中很多突变位于病毒重要的S蛋白中,包括近期三个S蛋白N501Y突变毒株(501Y.V1、501Y.V2和501Y.V3)引起了关注并得到了广泛的研究。S蛋白中的501位点已被...
Vignuzzi & Andino(2012)指出,RNA病毒的后代,基因组长度通常在7-12千碱基(kb)范围内,每个核苷酸位点往往有一个或两个不同的突变。严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因组的长度约为27-31 kb,这增加了获得的突变总数,但不一定增加了发病率。快速获得新基因...
简要总结一下：在SARS-CoV-2基因组中至少发生了353341次突变事件。但只有改变病毒生物学特性的突变才可以称为毒株；反之，它们只是变种。为了掌握有多少种病毒株，研究人员合成了106个SARS-CoV-2变种，这些变种被预测会改变病毒的生物学特性。结果显示，其中68种变异改变了传染性和免疫原性。但除D614G突变外，这些变...
麻省理工学院的研究人员对SARS-CoV-2基因组产生了他们认为最完整的基因注释。该研究团队还分析了自SARS-CoV-2开始感染人类以来,在不同的SARS-CoV-2分离株中出现的近2000个突变,让他们可以评估这些突变在改变病毒逃避免疫系统或变得更具传染性方面的能力。 马萨诸塞州剑桥——2020年初,在Covid-19大流行开始几个月...
比较SARS-CoV-2和其他的冠状病毒 这些最早的基因组序列数据清楚地表明SARS-CoV-2是乙型冠状病毒属(Betacoronavirus,有时也译为β冠状病毒属)的成员,属于一个包括SARS-CoV在内的Sarbecovirus亚属(MERS-CoV属于一个单独的亚属:Merbecovirus)。确实,初步比较显示SARS-CoV-2在核苷酸水平上与SARS-CoV的相似度约为79%...
自2019年11月SARS-CoV-2病毒出现以来，已经出现了几种令人担忧的变种(VOCs)，并迅速在全球传播。Omicron变异株于2021年11月中旬在南非首次被发现，并于2021年11月26日被指定为VOC。与野生型病毒相比，最初的Omicron-BA.1基因组的Spike区有35个突变，包括30个氨基酸替换，3个缺失，3个氨基酸插入。其中15个突变位于...
基于当前的数据,SARS-CoV-2的变异速度似乎要比季节性流感要慢很多,具体而言,SARS-CoV-2的突变率似乎每年不到25次,而季节性流感的突变率达到了每年几乎50次;鉴于SARS-CoV-2的基因组几乎是季节性流感基因组的两倍,因此,季节性流感的突变速度似乎是SARS-CoV-2的4倍左右;实际上,季节性流感突变的速度如此之外,正是...
图2 印度分离株 SARS-CoV-2 基因组的变异分析。该图的上图表示 SARS-CoV-2 班加罗尔分离株基因组序列中的核苷酸变异 (SNPs) 与Wuhan-Hu-1分离株完整基因组序列的对比。下面板指示错义突变相对于Wuhan-Hu-1，SARS-CoV-2 分离株的位置。2.SARS-CoV-2的临床蛋白质组学利用错误发现率(FDR)≤1%的MS/MS识别出...
SARS-CoV-2属于β-冠状病毒科的一个亚属(2)它是7种人类冠状病毒(HCOV)之一,可引起从普通感冒到严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS)的人类疾病。与其他HCOV病毒一样,SARS-CoV-2是一种包膜、阳性(+)单链RNA病毒,平均基因组大小为29.7?kb。病毒进入宿主细胞后,(+)ssRNA病毒基因组释放到细胞质中,...
结果发现,蝙蝠具有特别高的加速进化水平,其加速残基中的T27和M82是SARS-CoV-2 S的结合残基,Q728则在除果蝠外的37种蝙蝠中均完美保守。这表明相对于其他哺乳动物,ACE2在蝙蝠中处于谱系特异性选择压力之下。 简而言之,该项研究结合比较基因组学和蛋白质结构分析的方法,对脊椎动物物种中ACE2 与SARS-CoV-2 S的...