利用综合比较基因组学和机器学习技术,我们确定了将SARS-CoV-2和前两次致命冠状病毒暴发背后的病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV))与更小毒性的病毒区分开来的关键基因组特征, 这些特征包括核蛋白壳中的核定位信号增强和刺突糖蛋白(Spike Protein)中的独特插入方式,这些特征似乎与这些冠状病毒的高病死...
截至2021年1月11日,GISAID中共有355067个SARS-CoV-2基因组序列,通过对比3823个代表性病毒基因组与早期参考毒株,研究人员发现SARS-CoV-2在过去一年内平均每天积累了约0.035个氨基酸突变,但S蛋白则呈现出非线性突变模式,这表明整个基因组受到的选择压力可能不同,最近发现的3个SARS-CoV-2变体N501Y.V1、N501Y.V2和N501Y...
了确定区分导致人畜共患病传播给人类的高病死率病毒的基因组决定因素,我们使用了MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2的核苷酸MSA,以及这些病毒中选择的近端非人类冠状病毒。我们搜索最大化以下函数的区域: S是编码后的MSA中的一个位置(“1”表示核苷酸,“0”表示空白),V是MERS-CoV、SARS-CoV或SARS-CoV-2中选择的...
Q677突变位于SARS-CoV-2棘突蛋白一侧,因此表明它可能在增加病毒进入人类细胞的穿透性方面发挥作用。迄今为止,已在几个不同的SARS-CoV-2变异谱系中鉴定出Q777突变,其中七个已在美国鉴定。与先前存在的突变相比,Q677变体尚未被确定为更具传染性。 SARS-CoV-2基因组的...
最终,一项研究将SARS-CoV-2基因组序列与该实验室早期从云南采集到的中菊头蝠(Rhinolophus affinis)体内检测到的Bat-Cov-RaTG13冠状病毒株基因组序列进行比较,发现两者全基因组水平一致性高达96.2%,同时也发现两者的S基因片段差异性最大(基因同源性为93.1%)[27]。这一研究直接将SARS-CoV-2的自然宿主溯源工作推进到...
根据英国COVID-19 Genomics UK Consortium（COG-UK）公司的SARS-CoV-2基因组最新研究，英国的COVID-19经历了由不同的SARS-CoV-2毒株引发的多种流行病和亚流行病。Wellcome Sanger研究所COVID基因组项目(COVID Genomics Initiative)负责人兼共同高级和共同通讯作者Jeffrey Barrett在一份声明中表示，“这些基因组监测...
作为一种RNA病毒,SARS-Cov-2进入宿主细胞复制基因组RNA并产生许多较小的RNA(称为亚基因组RNA)。这些亚基因组RNA用于合成SARS-Cov-2开始所需的各种蛋白质(刺突蛋白、囊膜蛋白等)。因此,较小的RNAs是破坏新冠状病毒攻克我们免疫系统的好目标。尽管最近的研究报告了RNA基因组序列,但只预测了基因的可能位置,具体定位...
56个SARS-CoV-2基因组的可视化 来源:Martin Krzywinski/SPL 自2020年1月以来,研究人员已经在网上公布了大量的SARS-CoV-2基因组序列。目前最流行的数据共享平台为GISAID,它拥有超过45万个病毒基因组;世界卫生组织首席科学家 Soumya Swaminathan表示,GISAID是大流行中“游戏规则改变者”。然而,欧洲生物信息学研究所(EBI...
2020年3月31日讯/生物谷BIOON/---新型人类冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)的持续大流行引起了全球的极大关注。我们和中国的其他人参与了对这种病毒的初始基因组测序。在本文中,我们描述了针对SARS-CoV-2的出现,这些基因组数据揭示了什么,并讨论了我们对其起源理解上的差距。一种新的人类冠状病毒2019年12...
研究发现,肆虐全球的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的基因组为单链RNA。基于其特异性的基因组序列,科研工作者研制的新型冠状病毒核酸检测试剂盒(RT-PCR荧光探针法)为新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控提供了快速、精准的检测方案。RT-PCR荧光探针法通过荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,通过...