RT-PCR数据分析方法(相对定量) 1.1.以质量单位作为标准进行相对定量 条件:要求准确地量化初始材料,如细胞数目或核酸的微克数。 当用相对定量法比较多个样本时,选择一个样本作为校验样本(Calibrator,即对照),所有样本目标基因的表达都以对照为标准上调或下调。通常用未处理作为对照。 用试验样品和对照样品的CT值来计算...
根据正态、方差齐、样本量等选择分析方法 我替别人做这类的数据分析蛮多的
分享自己关于qPCR(RT-PCR)数据相对定量的分析方法与经验(相对定量,目的基因,对照组,基因) qPCR的数据相对定量分析其实很简单。我做了很多的qPCR实验,也看了很多的资料,包括Nature protocol, AB官方的分析教程,MIQE,甚至包括一些商业化软件使用的教程及教程里面记述的原理。 我在这里跟大家分享一下自己的经验,最常用,...
PCR的三种数据分析方法(2原吟吟CT尧REST2009和RESTMCS)的异同遥方法以正常小鼠来源的cDNA混合物阳性对照为模板袁5倍系列稀释袁分别做miRNA-181a和SnRNAU6的标准曲线遥实时荧光定量PCR检测正常组和哮喘组小鼠脾脏CD4+T细胞miRNA-181a和SnRNAU6表达水平袁以SnRNAU6为内参基因袁采用2原吟吟CT尧REST2009和RESTMCS方法袁...
RT-PCR数据分析方法(相对定量) 1. 以质量单位作为标准进行相对定量 条件:要求准确地量化初始材料,如细胞数目或核酸的微克数。 当用相对定量法比较多个样本时,选择一个样本作为校验样本(Calibrator,即对照),所有样本目标基因的表达都以对照为标准上调或下调。通常用未处理作为对照。 用试验样品和对照样品的CT值来计算...
RT-PCR数据分析方法(相对定量) 1.以质量单位作为标准进行相对定量 条件:要求准确地量化初始材料,如细胞数目或核酸的微克数。 当用相对定量法比较多个样本时,选择一个样本作为校验样本(Calibrator,即对照),所有样本目标基因的表达都以对照为标准上调或下调。通常用未处理作为对照。
所以,我用的方法就是只计算到-△△Ct这一步就够了,这样得到的数据就有了正值与负值,正值表示较对照组mRNA上调,负值表示较对照组mRNA下调,作出图来非常直观,一目了然,也没有放大效应,显著性分析较为靠谱。这种运算方法最关键的在于负号以及实验组和对照组要分清楚!要不就得到相反的结果。
所以,我用的方法就是只计算到-△△Ct这一步就够了,这样得到的数据就有了正值与负值,正值表示较对照组mRNA上调,负值表示较对照组mRNA下调,作出图来非常直观,一目了然,也没有放大效应,显著性分析较为靠谱。这种运算方法最关键的在于负号以及实验组和对照组要分清楚!要不就得到相反的结果。
我在这里跟大家分享一下自己的经验,最常用,最普遍的相对定量方法就是2^-△△Ct法,该法最最简单的说就是:首先将一次实验的所有基因Ct值整理好,之后用每一组样本自身的目的基因Ct值减去自身内参基因Ct值,得到的数就是△Ct;换成公式就是:△Ct=Ct(目的基因)-Ct(内参基因);然后,将每一组样本每一个目的基因的...