本文将对RNA测序技术、转录组分析技术以及其应用领域进行探讨。 一、RNA测序技术 RNA测序技术是一种通过高通量测序,对生物样本中的RNA分子进行全面、精确的分析的技术手段。它的发展使得研究人员可以在转录水平上揭示基因组的整体特征和调控机制。从技术原理上来看,RNA测序主要包括样品准备、文库构建、测序、数据分析等...
子宫内膜-肌层连接处(EMJ)是连接子宫内膜和子宫肌层的纽带,对子宫腺肌病的诊断和分型具有重要意义,本研究使用单细胞RNA测序和空间图谱,绘制了在位内膜、病变和EMJ之间的转录变化图谱。在病变内,确定了独特的上皮亚群(LGR5+)、侵袭性间质(PKIB+)亚群以及WFDC1+祖细胞。此外,还观察到内皮细胞的异质性和涉及血管...
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三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术,它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题,并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理: 三代全长转录组测序:三代测序技术主要包括PacBio SMRT(Single Molecule Real-Time)和Oxford Nanopore等。这些技术通过直接测序RNA...
生物体中总RNA=(～90%)rRNA+ (1～2%)mRNA+(8～9%)其他RNA 对于真核生物,可通过 oligo dT磁珠富集mRNA来进行建库 而如果想研究lncRNA、全转录组或原核生物转录组,可以通过去除rRNA的方法进行建库 建库另一个要考虑的方面: 链特异性与非特异性(stranded or un-stranded) ...
子宫内膜-肌层连接处(EMJ)是连接子宫内膜和子宫肌层的纽带,对子宫腺肌病的诊断和分型具有重要意义,本研究使用单细胞RNA测序和空间图谱,绘制了在位内膜、病变和EMJ之间的转录变化图谱。在病变内,确定了独特的上皮亚群(LGR5+)、侵袭性间质(PKIB+)亚群以及WFDC1+祖细胞。此外,还观察到内皮细胞的异质性和涉及血管...
转录组测序（RNA-seq）的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先，根据研究目标选择合适的策略，如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA，而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性，有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下：总RNA提取：检查纯度、浓度和完整性...
三代全长转录组测序与 RNA-seq 在技术原理和数据类型上有显著区别。RNA-seq 通常采用二代测序技术(如 Illumina),生成短序列片段,需要拼接和基因注释来重构转录本,而三代全长转录组测序使用第三代技术(如 PacBio 或 Oxford Nanopore),能够直接测序较长的 RNA 分子,获得完整的转录本。由于三代测序直接提供完整的...
而二代测序由于原理的限制，RNA都是打碎到几十至一两百bp的片段测的。全长转录组测序最大的优势就是...
高通量测序 全转录组测序(Total RNA-Seq) 项目介绍 全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。 基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA...