图示解释: 在RNA-seq项目中,每个椭圆表示一个比较组合(处理组 vs对照组)中的差异基因,椭圆重叠区域的数字表示对应的多个比较组合之间的共有差异基因个数,未重叠区域表示各比较组合特有的差异基因。可以通过与韦恩图对应的表格,可以看到比较组合共有和特有的基因信息。 ...
在RNA-seq项目中,每个椭圆表示一个比较组合(处理组 vs对照组)中的差异基因,椭圆重叠区域的数字表示对应的多个比较组合之间的共有差异基因个数,未重叠区域表示各比较组合特有的差异基因。可以通过与韦恩图对应的表格,可以看到比较组合共有和特有的基因信息。 聚类热图 热图以特殊高亮的形式显示访客热衷的页面区域和访客...
install.packages("pheatmap")library(pheatmap)inputdata<-read.csv('pheatmap.csv',row.names=1,header=T)inputdata<-as.matrix(inputdata)bk=unique(c(seq(0,7,length=100)))pheatmap(log(inputdata+1),breaks=bk,cluster_col=FALSE,legend_breaks=c(1:100),cellwidth=60,cellheight=9,border=FALSE) im...
英文名称: RNA-Seq Library Preparation Kit for RNA Profiling 总访问: 374 国产/进口: 国产 半年访问: 40 产地/品牌: Gnomegen 产品类别: 分子生物学试剂 规格: K02421-TL/K02421-PL 最后更新: 2016-5-30 货号: CAS 号: 参考报价: ￥22000.0 立即询价 电话咨询 ...
TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit 品牌:美国宜曼达 产地: 供应商报价:面议 宜曼达贸易(上海)有限公司 销售范围售全国 入驻年限第9年 营业执照 同类产品 立即扫码咨询 联系方式:400-822-6768 联系我们时请说明在仪器网(www.yiqi.com)上看到的!
RNA-seq中,火山图(Volcano Plot)显示了两个重要的指标:fold change和校正后的p value,利用T检验分析出两样本间显著差异表达的基因后,以log2(fold change)为横坐标,以T检验显著性检验p值的负对数-log10(padj)为纵坐标。 图示解释: 红色点表示TS样本相对于对照样本CK表达量上调的基因,绿色点表示下调基因。 纵坐...
Poly(A) mRNA was isolated from Universal Human Reference RNA (Agilent #740000) using the NEXTFLEX® Poly(A) beads 2.0 and the Competitor N Poly(A) enrichment kit. Libraries were generated using the NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq kit 2.0 and the Competitor N’s library preparation ...
在RNA-seq项目中,常见的结果图片包括:火山图、韦恩图、聚类热图、log2(ratios)折线图、有向无环图、散点图、代谢通路图、蛋白互作网络图等等。 本期,我们先来看看火山图、韦恩图、聚类热图和折线图。 火山图 RNA-seq中,火山图(Volcano Plot)显示了两个重要的指标:fold change和校正后的p value,利用T检验分析...