有⼀些含量的突然变化，属于正常的测序bias。Pat2⽤于展⽰RNA-seq测序数据是否来源于RNA 花了⼤价钱完成RNA测序，获得的数据如果不是来源于RNA，就等于钱⽩花了。所以，测 序数据与参考序列的⽐对分析，是RNAseq数据分析关键的⼀步，通常使⽤RNA_seQc软件绘制 序列⽐对饼状图。03样本reads在参考...
▶Bulk组学对下一步分析的意义:相较于蛋白组学,RNA-seq灵敏度更高,能够捕捉到蛋白质组学探测不到的基因表达变化。在钙化阶段,RNA测序显示出更多的过表达转录本,提示钙化阶段的细胞环境更加复杂,存在更多的免疫细胞浸润。然而,由于蛋白质才是驱动疾病发展的主要功能实体,研究决定在后续研究中重点关注主动脉瓣的蛋白组...
测序原理可以在优酷上搜“illumina二代测序原理”“陈巍学基因” 参考组装算法综述
在另外一例患者中,OGM 发现了复杂染色体重排事件,结合RNA-seq对缺失区域和断裂点破坏基因进行分析发现的候选基因有待进一步研究。 图1. 结合OGM和RNA-seq对SVs的分析及过滤流程。 1. OGM帮助发现非编码区SVs,RNA-seq在转录水平分析基...
本系列推送旨在带领生信零基础的科研人一起掌握Bulk RNA-seq数据分析,同时为其他Bulk组学和单细胞(核)转录组测序的数据分析奠定基础。 往期回顾: 第1期. 快2024年了,还有必要学习Bulk RNA-seq? 第2期. 零基础画PCA图 第3期. 基因ID转换,一键搞定
RNA直接测序来了:今是科技的G-seq500正式进入RNA直接测序领域,根据已有信息,作为全球唯二直接测序平台之一,其无需反转录和接头连接的建库流程大大简化了操作。该平台RNA直接测序读长超过5kb,原始单碱基准确率高,对环状RNA的读取尤为准确,单次可输出超100k高质量reads,为RNA研究提供了高效、精准的工具。
本项目利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组分析,绘制了异位子宫内膜、病变和EMJ的转录改变。在病变中,发现了独特的上皮(LGR5+)和侵袭性基质(PKIB+)亚群,以及WFDC1+祖细胞,支持“内陷”和“化生”发病理论之间复杂的相互作用。此外,还观察到内皮细胞的异质性和异常的血管生成信号,涉及血管内皮生长因子和血管...
1. 基于scRNA-seq探究组织特异性的γ δ T细胞表达图谱 Figure 1. 基于scRNA-seq分析γ δ T图谱特征 Fig. 1a展示了该篇文章的取样方案,作者基于MACS和FACS分选出小鼠胸腺、脾脏和淋巴结γ δ T细胞进行单细胞转录组测序,三个样本分别捕获了5394、2702和4818个细胞。tSNE降维聚类发现,一些亚群在每个组织中均有...
小RNA测序技术(Small RNA-seq,sRNA-seq) 英文名称: 总访问: 4559 国产/进口: 进口 半年访问: 79 产地/品牌: 上海交大丰核信息科技有限公司 产品类别: 测序/基因分析 型号: 小RNA测序技术(Small RNA-seq,sRNA-seq) 最后更新: 2020-12-14 货号: 参考报价: 立即询价 电话咨询 ...
单细胞测序网讯:2023年2月22日,来自德国马克斯·普朗克生物智能研究所的HerwigBaier教授团队在Science Advances上发表了题为“A single-cell resolution gene expression atlas of the larval zebrafish brain”的资源型论文,作者使用优化后的HCR技术构建了整个幼体斑马鱼大脑的空间层面的单细胞分辨率基因表达图谱。深入研究了...