如Expression of hub genes of endothelial cells in glioblastoma-A prognostic model for GBM patients integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing中下图所示 最初我完成该图的方法是用含有基因表达的热图,然后截图或者PS成只有临床指标。这里介绍使用ComplexHeatmap直接完成该图。 一 载入R包,数...
转录组数据综合分析 1/3 创建者:Edword-xuan 收藏 RNA-seq 生物信息学 热图 火山图 KEGG富集分析 1.8万播放 RNA-seq转录组数据分析入门实战 21.0万播放 R语言DESeq2包做转录组RNAseq差异表达分析的一个简单小例子 5.5万播放01:28 【“易”分钟系列】快速看懂结题报告分析图:KEGG富集气泡图-欧易生物 ...
RNA-seq数据分析:从差异基因到关键基因的进一步筛选 贝纳基因 2835 0 01:28 【“易”分钟系列】快速看懂结题报告分析图:KEGG富集气泡图-欧易生物 上海欧易生物 1.7万 0 03:29 10. GO和KEGG富集分析 生信幻想家 3.8万 2 03:22 11. Kaplan–Meier 生存分析 生信幻想家 1.4万 2 14:58 代谢物...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开聚类热图绘制页面。左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。也可以在主页搜索框中搜索heatmap,找到绘图页面。 https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_cluster_heatmap_plot_024 图2.可视化绘图页面 2,示例数据 点击右侧“示例数据”链接...
使用R从RNA-seq数据绘制热图代码 使⽤R从RNA-seq数据绘制热图代码 ⽂/伍鸿荣 要做热图，⾸先我们是要准备好数据，⽐如说TCGA的rna-seq，或者你⾃个测有的数据。然后可能利⽤deseq 包进⾏差异分析。⽐如说作者提出的⽤阿扎胞苷对AML3细胞影响的基因表达谱数据。数据筛选：在热图上绘制所有5704个...
拿了一组RNA-seq数据，用药组和对照组的转录组，每个都有两个独立重复 想按照功能把所有基因分类，然后...
拿了一组RNA-seq数据，用药组和对照组的转录组，每个都有两个独立重复 想按照功能把所有基因分类，然后...
二 临床指标热图可视化 1,直接绘制 使用ComplexHeatmap绘制临床数据注释图 ,重点在于构建一个和临床数据相同列的0矩阵 。 # 提取想展示的临床数据riskScore_cli2 <- riskScore_cli2 %>% select(riskScore:tumor_stage,Age) %>% select(- "age")# 构建列注释块ha=HeatmapAnnotation(df=riskScore_cli2)# 构...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开聚类热图绘制页面。左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。也可以在主页搜索框中搜索heatmap,找到绘图页面。 https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_cluster_heatmap_plot_024 ...
如Expression of hub genes of endothelial cells in glioblastoma-A prognostic model for GBM patients integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing中下图所示 最初我完成该图的方法是用含有基因表达的热图,然后截图或者PS成只有临床指标。这里介绍使用ComplexHeatmap直接完成该图。