转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
当测序深度足够深的时侯,在每一个位点,都有10几次、或者几10次的覆盖的时侯,我们就可以比较有把握地来判断出,哪儿有了一个新的剪接点,哪儿出现了一个断点,哪儿的碱基发生了突变。 可变剪接: 可变剪接,在真核生物中普通存在。一般一个人的组织样本当中,可以通过高通量测序,发现有5000个到20000个左右的可变剪接。
RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
RNA高通量测序(RNA-sequencing,缩写为RNA-seq)是目前高通量测序技术中被用得最广的一种技术,RNA-seq可以帮助我们了解:各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异。它可以检测的差异有:正常组织和肿瘤组织的之间的差异;也可以检测药物治疗前后基因表达的差异;还可以检测发育过程中,不同的发育阶段,不同的组织之间的基因...
3'-Digital Gene Expression(3'-DGE)RNA-Seq是一种相对较新的 RNA 测序方法。它靶向每个转录本的3'-末端,并针对这种差异基因表达项目进行了优化。3'-Digital Gene Expression中的"digital"指的是计数,这种RNA测序方法有时也被称为 "转录本计数法"。
RNA-seq是一种高通量测序技术,用于研究细胞内的RNA组成和表达水平。它能够帮助科研人员了解基因的转录活动、可变剪接、单核苷酸多态性和基因表达调控等方面的信息。 在RNA-seq研究中,首先需要从样本中提取RNA,并通过反转录生成cDNA。然后对cDNA进行测序,得到数百万条短序列。这些序列被比对到基因组上,从而确定它们的来...
在过去的十年中,作为一种用于提供高分辨率转录组信息的技术,RNA测序(RNA-Seq)变得越来越流行。转录组是单个细胞或细胞群中所有RNA转录本的集合,转录组数据可以深入揭示从转录调控、细胞分化到致癌作用等的一系列过程。 成功的RNA-Seq首先要制备高质量的RNA文库,其主要步骤是首先将RNA片段化、随后将RNA转化为cDNA、再...
RNA-Seq测序,又称RNA sequence测序,即转录组测序,简称RNA测序,就是用高通量测序技术进行测序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表达水平。 什么是转录组? 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生...
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性:高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计,例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外,该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合,如ChIP-seq、甲基化测序等,从而进一步扩展了其应用范围。