转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
转录组测序简称RNA-seq,是一种高通量技术,用于分析细胞或者组织在特定条件下的RNA分子组成,换句话说,RNA-seq是对某个条件下生物体的转录状态拍了一张快照。通过这种技术,研究人员可以了解基因表达的模式,包括哪些基因被激活或抑制,以及它们的表达水平如何变化。 近年来,随着测序成本的不断降低,RNA-seq已经成为生物学...
转录组学RNA-Seq生信分析 一、转录组分析有两条路1、有参考基因组的比对STAR;2、无参考基因组比对salmon;然后使用DESeq2和limma、edgeR包做差异分析source deactivate WES_analyzCNV conda deactivate WES_analyzC… 法医鉴定发表于Dr家硕的... 转录组测序技术和结果解读(十三)——WGCNA分析 红皇后学术发表于红皇后...
转录组是指某特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。RNA测序(RNAseq)自诞生起就应用于分子生物学,帮助理解各个层面的基因功能。现在的RNA-seq更常用于分析差异基因表达...
《生物信息学:转录组测序(RNA-seq)分析》 知识 科学科普 课程 DLAB实验室 RNA 测序 生信分析 DLab实验室 发消息 持续分享(7大模块):【效率神器】、【生信测序】、【基础实验】、【方案设计】、【统计分析】、【翻译投稿】、【医药资讯】 充电 关注6.1万 ...
鉴于各种肿瘤以及其它疾病已有大量的RNA-seq数据发表以及MiXCR和TRUST4等相关软件的开发和成熟，从RNA-seq数据挖掘BCR/TCR信息具有很高的可行性。此外，相对于成本更高以及公共数据更少的免疫组库测序，基于转录组测序的免疫组库分析在大样本队列研究方面具有更多优势，有利于在大样本维度下获取新的重要发现。此外，对...
转录组测序(RNA-seq)就是利用高通量测序技术将细胞或组织中全部或部分mRNA、small RNA和no-codingRNA进行测序分析的技术。RNA-seq既可以提供定量分析,检测基因表达水平差异,又可以提供结构分析,能发现稀有转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合等,而且不依赖于参考基因组。
【题目】简述RNA-seq技术进行转录组学分析的原理。 答案 【解析】利用高通量测序技术对转录组进行测序分析,对测序得到的大量原始读长(reads)进行过滤、组装及生物信息学分析的过程被称为RNA-Soq。对于有参考基因组序列的物种,需要根据参考序列进行组装,对于没有参考序列的,需要进行从头组装,利用大量读长之间重叠覆盖和...
质量控制：首先需要检查RNA-seq数据的质量，可以使用FastQC等工具对原始数据进行质量评估，这一步也可以...