当有多组RNA-seq数据时,有时需要对多个组合进行差异表达分析,例如当我有CIM0/CIM7/CIM14/CIM28四组时,我需要得到每个组合间的差异表达情况,CIM7:CIM0; CIM14:CIM0; CIM14:CIM7等。使用ANOVA的方式也可以进行多组间比较,但由于ANOVA是指定同一个CK,并且不能得到具体是哪组相对于CK有差异表达,不能精准的解...
你准备一个分组文件，像课程一样做成两列，第一列为样本，第二列为分组，其他不相干的样本删除；
续断菊重金属转录组[目的]初步探索间作系统中重金属超富集植物续断菊对镉,铅吸收,转运,结合的分子机制,为进一步进行超富集植物续断菊转录组差异表达基因分析及耐重金属相关基因,重金属转运相关基因挖掘奠定基础.[方法]本研究采用RNA-Seq技术对间作系统中续断菊根组织转录组进行分析.[结果]通过Illumina HiSeqTM 2000...