rna-seq测序原理 RNA-seq测序是一种可以用于研究基因组学、组学、转录组学等领域的测序技术。它可以用来研究基因的表达模式、基因的功能和蛋白质的表达,以及物种特异性的基因组变异。 RNA-seq是一种高通量的测序技术,可以同时测量数以万计的基因,并识别基因组中的差异,从而获得更多的信息。它可以被用来研究物种之间的差异,以及物种
一般我们说 RNA-seq指的都是mRNA-seq,后面的流程也都是主要针对mRNA-seq数据分析的。在科 学家们的努力下,可以把那些非编码 RNA提取出来建库,进行测序。 一个成功的 RNA-seq研究,起决定性因素的是一个好的实验设计。还依赖于建库的类型、测 序深度和设置适于的生物重复。并且尽量减少测序本身以外带来的数据误差...
Illumina测序原理是基于NGS(下一代测序技术),也被称为第二代测序技术。这种技术相比第一代测序技术具有更高的测序通量。 具体到RNA-Seq(转录组测序),其测序原理如下: 1.样本准备:首先,需要从研究样本中提取总RNA。 2.建库:将RNA样本进行反转录,生成cDNA。然后,通过PCR扩增,将cDNA片段固定在测序芯片上。 3.测序...
1.RNA-seq的测序误差主要由生物学误差(生物学重复,比如取30只小鼠采样)和技术性误差(技术性重复,比如对1只小鼠采样3次)造成,如果想要得到的数据为无偏的,那么生物学重复最重要,因为生物个体代表着样本,而技术手段只会造成不可控干扰。总的来说,只做技术性重复的实验结果偏差最大,技术性重复+生物学重复的实验结果...
单细胞RNA测序,通常简称为scRNA-seq。这项技术使研究人员能够深入了解单个细胞的基因表达模式,揭示了生物体内的细胞异质性和功能多样性。
Bulk RNA-seq技术原理:1. 提取RNA:从样品中提取总RNA,包括mRNA、rRNA、tRNA等。2. RNA库构建:将提取的RNA进行反转录,并通过PCR扩增,构建成RNA-seq文库。3.测序:将文库通过高通量测序技术测序,得到大量的RNA序列数据。4. 数据分析:对RNA序列数据进行质量控制、比对到基因组和转录组、基因表达量计算和差异...
如何确定测序序列来自哪个细胞?单细胞RNA-seq的最大区别在于使用cell barcode进行标记。为了保证每个beads只捕获一个cell,需控制cell和beads的流速和数量。后续步骤包括添加UMI、连接beads、cDNA的PCR扩增等。PCR原理:- 利用Poly(dT)捕获mRNA,插入TSO引物进行反转录,生成cDNA的第一条链。- 将mRNA溶解,...
转录组测序(RNA-seq)的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先,根据研究目标选择合适的策略,如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA,而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性,有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下:总RNA提取:检查纯度、浓度和完整性...
搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1927、弹幕量 4、点赞数 62、投硬币枚数 27、收藏人数 175、转发人数 24, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做