本实验拟探究CRC细胞中FOXQ1的转录调控功能并寻找其下游基因。方法:(1)构建低表达FOXQ1基因的稳定转染CRC细胞株;(2)应用RNA seq检测FOXQ1敲低前后表达量显著差异的基因;(3)应用转座酶可接近性核染色质区域测序分析(Assay for Trans posase-Accessible Chromatin using sequencing,ATAC seq)检测FOXQ1敲低前后细胞染色...
本实验联合应用RNA-seq与ATAC-seq寻找由FOXQ1敲低引起的染色质易接近性改变所导致的表达改变基因,即FOXQ1转录因子调控的潜在下游基因。 1 材料和方法 1.1 细胞、仪器和试剂 本实验所用细胞系均购于中科院上海细胞库,DMEM高糖培养液、RPMI 1640培养液购于美国Corning公司,胎牛血清购于美国Gibco公司。Puromycin购于...