表达谱芯片(Microarray)和转录组测序(RNA-seq)技术是基因表达检测的重要手段,但在实验设计、生物样品采集、RNA提取、文库构建方案、高通量测序平台、数据分析、实验室等方面引入误差,在数据中形成噪声,影响数据结果,掩盖真实的生物学结果,甚至导致错误的结论。 本研究利用四个标准RNA样品A、B、C和D,系统评...
《RNA-Seq策略探索福氏志贺氏菌体内外表达谱差异》是依托中国人民解放军军事科学院军事医学研究院,由王恒樑担任项目负责人的面上项目。中文摘要 痢疾是由志贺氏菌引起的严重肠道传染病,在今后相当长时间内仍将是传染病防治工作中的重点。本项目计划拟通过以Solexa测序方法为基础的转录表达谱研究(RNA-Seq),获得...
《RNA-seq 数据分析实用方法》是科学出版社出版的图书,作者是[芬]E.科佩莱恩,[芬]J.图梅拉,[芬]P.萨默沃,[瑞典]M.赫斯,[芬]G.旺 内容简介 本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法,内容涵盖数据分析的整个工作流程,包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的...
《用RNA-Seq新技术筛选和鉴定与荔枝落果相关的基因》是依托华南农业大学,由李建国担任项目负责人的面上项目。项目摘要 该项目以华南特色果树荔枝为对象,落果是其生产中亟待解决的一个瓶颈问题,果实脱落与调控的分子机理也是当今果实发育领域研究的一个热点问题。该项目在科学严谨的田间试验设计(植物生长调节剂延迟和...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学,由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平(GEL)的测量,GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用,但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
《基于高通量RNA-seq数据转录组拼接的关键技术与算法研究》是依托山东大学,由李国君担任项目负责人的重点项目。中文摘要 研究表明癌症等复杂疾病与转录过程中的可变剪接密切相关,因此认知转录产物的种类、特异性及表达量对于癌症机理研究及临床诊断具有重要意义。高通量的RNA-seq测序技术为揭示和研究真核生物转录组...
《高通量RNA-Seq数据的偏差建模和差异表达基因识别》是依托厦门大学,由王颖担任项目负责人的青年科学基金项目。项目摘要 本项目对高通量RNA-Seq数据的偏差建模和差异表达基因识别展开研究。本项目将碱基视为信息处理的基本单位,而外显子、基因等都可视为碱基单元的某种积分。分析偏差时,将可能的偏差因素作为解释变量,...
《基于RNA-Seq筛选的功能性LincRNA-NR_034037与乳腺癌发生发展的关联研究》是依托苏州大学,由周翊峰担任项目负责人的面上项目。项目摘要 研究表明LincRNA与多种恶性肿瘤存在着密切的关系。前期预实验中我们通过RNA-Seq的方法发现1q42染色体上TSNAX和DISC1基因间LincRNA-NR_034037在乳腺癌-癌...
《基于RNA-Seq与microRNA表达谱探讨杂色鲍杂种优势分子机理》是依托厦门大学,由游伟伟担任项目负责人的面上项目。项目摘要 杂种优势是普遍存在的一种复杂生物学现象,在水产动物的生产实践中已获得广泛应用,虽然人们已从生理生化、分子标记和QTL定位等多个方面开展了相关研究,但对其形成机理的研究迄今尚未明晰。随...