通过对RNA-seq、RIP-seq和RNA-BisSeq数据的综合分析,鉴定出163个转录本作为NSUN2的潜在靶点(图3d)。 为进一步确定NSUN2介导的基因调控机制,使用比值比(OR)来评估m5C高甲基化RNA或NSUN2结合转录本与NSUN2敲除卵巢癌细胞中差异表达基因(DEGs)之间的相关性。结果显示m5C修饰的RNA和NSUN2结合的RNA在NSUN2敲除后...
可以适当降低差异倍数和 fdr的值重新筛选一下差异基因；
RNA-Seq数据显示,围脂滴蛋白2(recombinant perilipin 2,PLIN2)的表达在OA+H37Ra组明显高于H37Ra组。在油酸诱导的巨噬细胞中,敲低PLIN2基因后的CFU结果显示,在H37Ra感染72h后,敲低PLIN2组的CFU中位数(四分位数)为86×104(78×104,96×104),明显高于对照空载体组[56×104(54×104,62×104)],差异有统计...
通过对RNA-seq、RIP-seq和RNA-BisSeq数据的综合分析,鉴定出163个转录本作为NSUN2的潜在靶点(图3d)。 为进一步确定NSUN2介导的基因调控机制,使用比值比(OR)来评估m5C高甲基化RNA或NSUN2结合转录本与NSUN2敲除卵巢癌细胞中差异表达基因(DEGs)之间的相关性。结果显示m5C修饰的RNA和NSUN2结合的RNA在NSUN2敲除后...