本综述对m5C RNA甲基转移酶进行全面综述,特别强调了m5C在癌症中的潜在作用机制,最后讨论了m5C相关研究前景。 介导m5C的RNA甲基转移酶 人的RNA m5C甲基化主要由NOL1/NOP2/sun家族和DNMT2催化,这对RNA稳定性和功能非常重要。甲基转移酶通过S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine)作为甲基供体形成m5C将甲基转移到胞嘧啶中...
Hu等人研究了结直肠癌5hmC在lncRNA中的分布和调控,发现hm5C分布在lncRNA中,并与lncRNA转录呈正相关。研究证实,hm5C通过hm5C修饰的超级增强子和启动子异常活性直接或间接调控失调的结直肠癌lncRNA。此外,hm5C还参与lncRNA位点的长染色质互作,且不同hm5C标记物调控的lncRNAs与不同的临床结果和肿瘤状态相关。 m5C作为...
常规mRNA m5C甲基化测序(RNA-BS): mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。 常规mRNA +lncRNAm5C甲基化测序(全转录组RNA-BS): 科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐处理...
这一观点通过使用G3BP1抗体的 RNA 结合蛋白免疫沉淀(RIP)测定得到证实(图6c)G3BP1在野生型HepG2细胞中与H19lncRNA特异性结合但在NSUN2缺失型HepG2细胞中不与H19lncRNA特异性结合的事实表明H19lncRNA与G3BP1蛋白的相互作用可能取决于NSUN2-介导的 RNA 甲基化。做了进一步的rEMSA实验使用带有或不带有m5C修饰...
2021年8月3日,中山大学肿瘤防治中心华南肿瘤学国家重点实验室研究团队在《Oncogene》杂志发表了《NSUN2-mediated RNA 5-methylcytosine promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via LIN28B-dependent GRB2 mRNA stabilization》的研究论文,该研究通过RNA-BS、RNA-seq等技术揭示NSUN2介导的RNA m5C甲基化...
近期,重庆医科大学附属第三医院妇产中心易萍教授团队揭示了RNA甲基转移酶NSUN2促进mRNA m5C修饰,并与转录因子E2F1在卵巢癌中形成正反馈调控回路(positive feedback regulatory loop)。具体来说,NSUN2促进E2F1 mRNA m5C修饰并增加其稳定性,而E2F1与NSUN2启动子相结合,又反过来激活NSUN2转录。RNA结合蛋白YBX1作为m5C ...
RNA-BS通常在成年哺乳动物组织中只鉴定出几百个mRNA m5C位点,这些有限的位点分类为两种类型:Type I m5C位点和Type II m5C位点。Type I m5C位点包含下游富含G的三联体motif,位于发夹结构的5'端,由NSUN2甲基化;Type II m5C位点,包含下游UCCA motif,位于发夹结构的环中,由NSUN6甲基化。
(1)m5C RNA-BS项目:RCMS编辑系统在特定细胞RNA位点的靶向m5C甲基化和去甲基化研究 期刊:Nucleic Acids Research影响因子:IF 16.6 样本:细胞 本研究作者开发了一种基于CRISPR-Cas13d的编辑系统,名为重编程m5C修饰系统(RCMS),用于特定转录本中的靶向m5C甲基化和去甲基化。通过m5C RNA-BS等分析揭示RCMS编辑系统能够精...
RNA甲基化(调取)建库测序的流程图如下: (一)TotalRNA样品检测 对RNA样品的检测主要包括3种方法: (二)⽂库构建 文库构建: 内容转载自易基因科技文章@易基因科技,想了解更多m5CRNA甲基化重亚硫酸盐测序技术可以看下易基因的这篇文章,表观组学研究找深圳易基因,提供专业的多组学科研服务。
常规mRNA m5C甲基化测序(RNA-BS): mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。常规mRNA +lncRNAm5C甲基化测序(全转录组RNA-BS): 易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐...