RNA targeting with CRISPR-Cas13. Nature 550, 280-284. doi: 10.1038/nature24049Abudayyeh OO, Gootenberg JS, Essletzbichler P, Han S, Joung J, Belanto JJ, Verdine V, Cox DBT, Kellner MJ, Regev A, et al. RNA targe
BecauseCRIPSRLwaCas13a can process its own pre-crRNA, it offers the possibility of streamlined multiplexed delivery of LwaCas13a guides13. We designed five different guides against the endogenous PPIB, CXCR4, KRAS, TINCR, and PCAT transcripts and delivered the targeting system as a CRISPR array ...
[1] Cox DBT, Gootenberg JS, Abudayyeh OO, Franklin B, Kellner MJ, Joung J, Zhang F. RNA editing with CRISPR-Cas13. Science. 2017 Nov 24;358(6366):1019-1027.[2] Kordyś M, Sen R, Warkocki Z. Applications of the versatile CRISPR-Cas13 RNA targeting system. Wiley Interdiscip Re...
张锋的原文是:RNA targeting with CRISPR Cas13a,详情可以查阅原文。 文章摘要 我们(张锋团队)证明了2类VI型、由RNA引导的RNA靶向CRISPR-Cas蛋白的效应子CRISPRCas13a蛋白(以前称为C2c2)可以被设计用于哺乳动物细胞RNA敲低和结合。 在初步筛选15个直向同源物后,我们鉴定了来自Leptotrichia wadei(LwaCas13a)的Cas13a...
CRISPR-Cas13系统属于Type VI家族,包括Cas13a、b、c、d等多个亚型。Cas13蛋白都是由多结构域组成的单一蛋白,具有识别crRNA、切割RNA、甚至是切割pre-crRNA的功能。Cas13蛋白具有2个标志性的HEPN结构域,2个R-XXXX-H保守基序是HEPN结构域的核酸酶活性位点。除了Cas13蛋白外,Type VI家族基因位点上还包含CRISPR array...
Cas13a结合和切割单链RNA。图片来自Stephen Dixon 如今,在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院(MIT)的研究人员对CRISPR-Cas13a系统进行调整,使之在哺乳动物细胞中发挥作用。相关研究结果于2017年10月4日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“RNA targeting with CRISPR–Cas13”。
如今,在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院(MIT)的研究人员对这种被称作CRISPR-Cas13a的系统进行调整,使之在哺乳动物细胞中发挥作用。相关研究结果于2017年10月4日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“RNA targeting with CRISPR–Cas13”。 Cas13a结合和切割单链RNA。图片来自Stephen Dixon。 在美国罗彻斯特大学开展...
具体来说，张锋团队制作了一个双质粒RNA靶向CRISPR系统（two-plasmid RNA-targeting CRISPR system）。一个质粒表达导向RNA（guide RNA），另一个表达Cas13a基因。研究结果显示，CRISPR-Cas13a有效地编辑了转录自一个报告质粒以及人类细胞中3个内源性基因的RNA。此外，该研究中，张锋团队还找到了一种所谓的Cas13“死亡...
2、RNA成像:研究人员对Cas13蛋白HEPN结构域R-XXXX-H基序进行突变,得到dCas13蛋白。dCas13蛋白丧失切割酶活性,但保留了结合酶活性,因此能够靶向目标RNA分子。目前有3种基于CRISPR-Cas13系统的RNA成像工具:Broad研究所张锋团队研发的dLwaCas13a-msfGFP融合蛋白、用于LncRNA失踪的dPspCas13b-EGFP、进行活体转录本成像的...
VI 型CRISPR/Cas系统结构示意图 与CRISPR II类系统的其它核酸酶结构一致，Cas13a的整体结构是双叶的，N...