RNA-seq常用的spike-in有 External RNA Controls Consortium mix (ERCCs),spike-in RNA variants (SIRVs)和sequencing spike-ins (Sequins)。由于spike-in的RNA浓度是预先知道的,并且浓度与产生的reads的数量直接相关,因此可以校准样品中转录本的表达水平。有人认为,如果没有spike-in对照,则不能正确地分析总体表达...
RNA 的 spike-in 一种绝对定量的方法,在原有的 RNAseq 文库中加入已知量的RNA 转录本,目前普遍使用的是 ERCC( The External RNA Control Consortium)。通过在样品制备过程中,混入指定数量的 spike-in,我们就可以知道不同样本中的基因绝对比表达值。 RNA-seq 常用的 spike-in 有 External RNA Controls Consortium...
spike-in方法:在RNA-Seq建库的过程中掺入一些预先知道序列信息以及序列绝对数量的内参。这样在进行RNA-Seq测序的时候就可以通过不同样本之间内参(spike-in)的量来做一条标准曲线,就可以非常准确地对不同样本之间的表达量进行矫正 比较常用的spike-in类型:ERCC Control RNA ERCC = External RNA Controls Consortium ER...
云序m6A meRIP-seq Plus(spike in)通过在实验过程中加入两类人工合成的spike in:阳性Spike-In(带m6A修饰)和阴性Spike-In(不带修饰),与样品一起进行MeRIP实验及后续测序分析,根据spike in的检测信号对MeRIP实验进行质控,确保实验流程的准确性、可重复性及抗体的特异性! 优势四:测序到验证、靶标定位到分子机制,云序...
云序m6A meRIP-seq Plus(spike in)通过在实验过程中加入两类人工合成的spike in:阳性Spike-In(带m6A修饰)和阴性Spike-In(不带修饰),与样品一起进行MeRIP实验及后续测序分析,根据spike in的检测信号对MeRIP实验进行质控,确保实验流程的准确性、可重复性及抗体的特异性!
产品名称:MicroRNA Spike In Kit 产品价格:¥13,155.00 产品介绍 产品内容 订购说明 目录所有产品主要以现货销售方式。同时,可根据需要订期货,可来人、电话、传真、E-MAIL进行订货,同时在公司网站(http://www.51jinda.com) 上可查询您所需要的产品信息。您可以免费索取我公司相关资料。
而且,两种样品中表达水平幅度变化的比率,可通过ExFold RNA Spike-In 1和ExFold RNA Spike-In 2(图3)之间高度一致的关系来计算,具有很高的可信度。由于内参混合物中各种转录本的摩尔浓度已知,使用92种转录本的4种亚群的不同比值的组合对两种混合物进行关联,即可确定测量值。这些对照品是下一代测序实验(如 SOLiD...
Spike-in对照可能会提高结构组分析的质量,但尚未得到广泛使用。SHAPE方法的比较揭示了仅在体内实验中明显的效率差异,强调了比较此类复杂方法时需要特殊注意。 这些方法揭示了RNA结构在基因和蛋白质调控机制中的新作用。例如,对DMS数据的分析发现,RNA结构可以调节APA,并可能减缓催化活性区域的翻译,从而为蛋白质折叠提供...
合成的 RNA 可变转录变体(Spike-In-RNA Variants,SIRVs,Lexogen)可用来模拟转录组复杂性分析。制备文库时,以极少的量加入样品中与内源性 RNA 共同建库,即可进行可变转录本定性或定量的比较分析。针对其来自 7 个人类模型基因的 69 个人工转录变体(0.16-2.5 kb),我们按照其转录本序列设计了探针。选取不同起始摩尔...
该分析工具被设计为,与NIST主持的External RNA Controls Consortium(ERCC)开发的RNA spike-in对照一起使用。这些ERCC对照是由External RNA对照(2013年由机构发行,标准参考资料2374)DNA序列实验室产生。 本文第一作者Sarah Munro称:“在基因表达实验中,科学家们试图通过同时量化基因组表达的几千个RNA分子,来了解细胞的...